用于鉴定沪玉糯3号糯玉米的SNP分子标记及其应用,包括核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示的分子标记SNP1、核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示的分子标记SNP2、核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示的分子标记SNP3、核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示的分子标记SNP4、核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示的分子标记SNP5和/或核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示的分子标记SNP6;该SNP分子标记为简单、快速、高效准确鉴定‘沪玉糯3号’的真实性奠定技术基础,同时为‘沪玉糯3号’基于分子生物学技术的深入研究提供了序列和SNP位点信息。