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[发明专利]基于领域本体的癌症用药知识库构建方法、系统及终端-CN202111398444.1有效
发明人：马超 -专利权人： 慧算医疗科技（上海）有限公司;慧算基因科技（上海）有限公司
申请日： 2021-11-24 - 公布日： 2022-03-08 - 主分类号： G06F40/295 文献下载
摘要：本发明的基于领域本体的癌症用药知识库构建方法、系统及终端，获取由创建的与癌症精准用药本体的目标领域相关的包括实体类别以及实体关系的本体框架；将癌症精准用药知识数据按照其所属的实体类别依次填入所述本体框架中对应的实体类别中，以构建癌症精准用药知识库；本发明通过确定“癌症精准用药”本体的领域和范畴，并以“特定生物标志物的肿瘤细胞”为核心概念来构建本体框架，融合领域相关的概念、术语及其逻辑关系，最终形成一个具有问题分析、逻辑推理能力的癌症精准用药本体知识库。
基于领域本体癌症用药知识库构建方法系统终端

[发明专利]医学文献中药物命名实体标准化方法、装置、设备和介质-CN202111077543.X在审
发明人：马超 -专利权人： 慧算医疗科技（上海）有限公司;慧算基因科技（上海）有限公司
申请日： 2021-09-15 - 公布日： 2021-12-07 - 主分类号： G06F40/295 文献下载
摘要：本申请提供了一种医学文献中药物命名实体标准化方法、装置、设备和介质，通过根据最新的UMLS数据集筛选出符合药物概念语义类型的数据，并根据最新的MESH数据集，解析其中药物入口词与其同义词；在MESH数据集中通过药物的实体名称查询所有相同概念编号的药物名称以及同义词名称，并将合并的查询结果作为该药物的同义词集合，据以遍历所有药物的同义词集合；对任意至少两个具有相同元素的同义词集合并，以作为一个新药物的同义词集合；为每个药物定义药物编号，以表征该集合的标准化药物名称。本申请通过整合UMLS、MESH等词汇库，可统一不同文本中识别出的药物名称，同时也可用来构建一全面的药物同义词语料库，用于医学自然语言处理的开发和应用。
医学文献药物命名实体标准化方法装置设备介质

[发明专利]一种高通量测序突变检测方法、设备、装置及可读存储介质-CN202110972081.1在审
发明人：李超 -专利权人： 慧算医疗科技（上海）有限公司;慧算基因科技（上海）有限公司
申请日： 2021-08-24 - 公布日： 2021-11-09 - 主分类号： G16B20/50 文献下载
摘要：本发明涉及生物技术领域，特别是涉及一种高通量测序突变检测方法、设备、装置及可读存储介质。本发明提供一种高通量测序突变检测方法，包括：获取基因样本中各候选突变位点的特征信息，所述特征信息来源于基因样本的高通量测序数据；将各候选突变位点进行层次聚类分析；获取各类候选突变位点的背景值pbg；获取各类候选突变位点的最低检测下限；确定各候选突变位点的检测阈值。本申请所提供的高通量测序突变检测方法，可以通过自适应优化的算法，针对每个样本特有的数据特点智能的设定分析的阈值，在保证阳性位点检出的前提下尽可能的去除噪音造成的假阳性，可以更加精准的从样本中检测突变，从而具有良好的产业化前景。
一种通量突变检测方法设备装置可读存储介质

[发明专利]基因高通量测序数据突变检测方法-CN201711214506.2有效
发明人：李超 -专利权人： 慧算医疗科技（上海）有限公司
申请日： 2017-11-28 - 公布日： 2020-04-24 - 主分类号： G16B20/50 文献下载
摘要：本发明提供一种基因高通量测序数据突变检测方法，包括步骤：S1：获取一基因样本的高通量测序数据；S2：生成所述基因样本的高通量测序数据的各基因序列的位置信息标签；S3：根据所述位置信息标签将各所述基因序列分组并计算获得一突变总量；S4：将所述突变总量代入一背景模型输出突变检测结果。本发明的一种基因高通量测序数据突变检测方法，采用虚拟分子标签与背景数据库结合的方法降低噪音，提高检测的特异性和敏感性，可在不增加实验成本的前提下能有效的降低实验中的随机误差，结合背景数据库对系统误差的校正，可以达到准确鉴定低丰度突变的目的。
基因通量序数突变检测方法

[发明专利]一种无对照体细胞突变检测方法及装置-CN201910395409.0有效
发明人：李超;王威;张兵 -专利权人： 慧算医疗科技（上海）有限公司
申请日： 2019-05-14 - 公布日： 2019-08-09 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：本发明提供一种无对照体细胞突变检测方法，所述方法无需正常组织对照，包括以下步骤：获取待测样本的突变基因位点的检测数据；基于聚类算法对突变基因位点进行相似聚类；注释各亚克隆内各突变基因位点；建立亚克隆预测模型；将各亚克隆内各突变基因位点注释信息输入到所述亚克隆预测模型中，预测各亚克隆属于第一克隆，第二克隆和第三克隆中的哪一类。在肿瘤治疗时，如果没有找到驱动突变而盲目治疗，靶向治疗效果较差，采用本发明可筛选出第一克隆即驱动克隆，进一步的即筛选出驱动突变，有助于根据驱动突变更加有针对性地选择合适的治疗药物和治疗方案，提高肿瘤的治疗效果。
亚克隆突变基因位点克隆驱动突变突变检测预测模型体细胞筛选靶向治疗待测样本检测数据聚类算法正常组织治疗效果治疗药物肿瘤治疗注释信息聚类治疗肿瘤预测

[实用新型]一种防止试管内液体温度过高或过低的保温装置-CN201721668883.9有效
发明人：张兵;杨少友 -专利权人： 慧算医疗科技（上海）有限公司
申请日： 2017-12-05 - 公布日： 2018-08-14 - 主分类号： B65D81/38 文献下载
摘要：本实用新型提供了一种防止试管内液体温度过高或过低的保温装置，包括内部保温防撞装置和外部保温防撞装置，所述内部保温防撞装置包括具有两个凹洞结构的防撞隔热装置，所述防撞隔热装置外侧设有一保温结构，所述保温结构设有一开口，所述开口用于向保温结构内灌装填充液；所述外部保温防撞装置包括外部保温层及与外部保温层的内壁相邻的空腔，本实用新型可用于短时间内样本周转，又可用于长时间运输，避免夏天或冬天极端条件下试管内液体的温度过高或过低。
防撞装置保温保温结构温度过高试管本实用新型外部保温装置隔热装置保温层防撞可用开口长时间运输极端条件填充液凹洞灌装空腔内壁样本周转

[实用新型]一种防止试管内液体温度过高或过低的包装盒-CN201721512576.1有效
发明人：张兵;杨少友 -专利权人： 慧算医疗科技（上海）有限公司
申请日： 2017-11-14 - 公布日： 2018-06-01 - 主分类号： B65D25/02 文献下载
摘要：本实用新型提供了一种防止试管内液体温度过高或过低的包装盒，包括外包装箱，所述外包装箱上端设有一箱盖，所述外包装箱内设有用于放置冰袋或自发热袋的空腔，所述空腔每侧设有一凸出部，所述空腔内安装有若干个防撞装置，所述防撞装置内设有一用于放置试管的凹洞，本实用新型提供一种简单、低成本的包装盒，既能防止试管运输过程中发生碰撞碎裂，又可防止试管内液体温度过高或过低，还可降低冬季包装的运输成本。
试管温度过高包装盒空腔本实用新型防撞装置外包装箱运输成本运输过程自发热袋碎裂低成本凸出部外包装上端凹洞冰袋箱盖

[发明专利]药物代谢酶代谢型评估方法-CN201711204791.X在审
发明人：马超 -专利权人： 慧算医疗科技（上海）有限公司
申请日： 2017-11-27 - 公布日： 2018-04-06 - 主分类号： G06F19/10 文献下载
摘要：本发明提供一种药物代谢酶代谢型评估方法，包括步骤S1自预设基因数据库获取基因的单倍型变异型等位基因命名并形成基因信息表；S2根据基因信息表获双倍型变异型等位基因命名序列；S3形成代谢型获得代谢型信息表；S4根据基因检测结果获得位点双倍型命名表；S5获得第一单倍型变异型等位基因命名序列；S6根据各单倍型变异型等位基因酶活性获得第二单倍型变异型等位基因命名序列；S7自第二单倍型变异型等位基因命名序列获得双倍型变异型等位基因命名结果；S8自代谢型信息表检索获得代谢型检测结果。本发明的一种药物代谢酶代谢型评估方法，可准确判断基因代谢型，在药物代谢酶基因检测与个性化用药方面具重要意义。
药物代谢评估方法

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