本发明公开了AGT1R基因SNP检测特异性引物和液相芯片,所述液相芯片主要包括:由5’端的tag序列和3’端的针对SNP位点的特异性引物序列组成的ASPE引物,所述特异性引物序列分别选自:SEQ ID NO.5及SEQ ID NO.6、和/或SEQ ID NO.7及SEQ ID NO.8;所述tag序列选自SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.4中的序列;微球;扩增引物。所制备的AGT1R基因SNP检测液相芯片具有非常好的信号-噪声比,并且所设计的探针以及anti-tag序列之间基本上不存在交叉反应。本发明设计的ASPE引物具有非常好的特异性,能准确区分各种类型的突变位点。
本发明公开了一种apo E基因SNP检测特异性引物和液相芯片,该液相芯片主要包括有:ASPE引物对,所述特异性引物是:针对C609T SNP位点的SEQ ID NO.17和SEQ ID NO.18、和/或针对T471C SNP位点的SEQ ID NO.19和SEQ ID NO.20;所述tag序列选自SEQ ID NO.1~SEQID NO.16;分别包被有特异的anti-tag序列的、具有不同颜色编码的微球,所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.33~SEQ ID NO.48中的序列;扩增引物。本发明还公开了一种apo E基因和染色体9p21区段SNP检测液相芯片。本发明所提供的液相芯片与测序法的检测结果吻合率高达100%。所制备的apo E和染色体9p21区段SNP检测液相芯片具有非常好的信号-噪声比。
本发明公开了一种EPHX1基因SNP检测液相芯片,主要包括有:针对EPHX1基因的SNP位点,分别设计的野生型和突变型的ASPE引物对:每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物组成,所述特异性引物选自SEQ ID NO.9~SEQ IDNO.16;所述tag序列选自SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.8;分别包被有特异的anti-tag序列的、具有不同颜色编码的微球,且所述anti-tag序列能相应地与所选的tag序列互补配对;以及用于扩增具有SNP位点的EPHX1基因目标序列的扩增引物。所述检测液相芯片具有非常好的信号-噪声比,能够避免交叉反应,且可以实现多个SNP位点的并行检测。
本发明公开了一种NPPA基因SNP检测特异性引物和液相芯片,该液相芯片主要包括有:由5’端的tag序列和3’端针对SNP位点的特异性引物组成的ASPE引物,所述特异性引物是:针对rs5063SNP位点的SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8、针对rs5065SNP位点的SEQ ID NO.9和SEQ ID NO.10、和/或针对rs5067SNP位点的SEQ ID NO.11和SEQ ID NO.12;所述tag序列选自SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.6;分别包被有特异的anti-tag序列的、具有不同颜色编码的微球;扩增引物。本发明所提供的液相芯片与测序法的结果吻合率高达100%。所制备的NPPA基因SNP检测液相芯片具有非常好的信号-噪声比。
本发明公开了一种GPIIIa基因SNP检测液相芯片和特异性引物,其主要包括有:针对GPIIIa基因的SNP位点,分别设计的野生型和突变型的ASPE引物对,每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因SNP位点的特异性引物组成;分别包被有特异的anti-tag序列的、具有不同颜色编码的微球,所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.17~SEQ ID NO.24中的序列,且所述anti-tag序列能相应地与每种ASPE引物中所选的tag序列互补配对;用于扩增出含有T196C SNP位点的GPIIIa基因目标序列的扩增引物。本发明还提供了一种COX-1和GPIIIa基因SNP检测液相芯片和特异性引物,该液相芯片除了具有GPIIIa基因的对应的组成外,还具有针对COX-1基因SNP位点的ASPE引物对、包被有特异的anti-tag序列的微球以及扩增引物。所述检测液相芯片具有非常好的信号-噪声比,能够避免交叉反应,且可以实现多个SNP位点的并行检测。
本发明公开了一种KIF6基因SNP检测液相芯片,该液相芯片主要包括有:ASPE引物对,每条ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对T2155C SNP位点的特异性引物组成,所述特异性引物是:SEQID NO.23和SEQ ID NO.24;所述tag序列选自SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.18;分别包被有特异的anti-tag序列的、具有不同颜色编码的微球;扩增引物。本发明还公开了apoE、KIF6基因和染色体9p21区段SNP检测的液相芯片。本发明所提供的检测方法与测序法的吻合率高达100%。所制备的apo E、KIF6基因和染色体9p21区段SNP检测液相芯片具有非常好的信号-噪声比。
本发明公开了一种katG、inhA和ndh基因突变检测特异性引物和液相芯片,所述液相芯片主要包括有:ASPE引物,每种ASPE的特异性引物选自:针对katG基因codon 315位点的SEQ IDNO.15及SEQ ID NO.16~20中的一种以上、针对katG基因G463T位点的SEQ ID NO.21及SEQ IDNO.22、针对inhA基因C(-15)T位点的SEQ ID NO.23及SEQ ID NO.24、针对ndh基因A110G的SEQ ID NO.25及SEQ ID NO.26、和/或针对ndh基因G268A位点的SEQ ID NO.27及SEQ ID NO.28;微球;扩增引物。本发明所提供的katG、inhA和ndh基因突变检测液相芯片的检测结果与测序法的吻合率高达100%,且检测所需的时间远远低于常用的测序技术。
本发明公开了一种rpsL和rrs基因SNP检测液相芯片,主要包括有:ASPE引物,所述ASPE引物特异性引物选自:针对rpsL基因A43G位点的SEQ ID NO.14及SEQ ID NO.15、针对rpsL基因A88G位点的SEQ ID NO.16及SEQ ID NO.17、针对rrs基因G426C位点的SEQ ID NO.18及SEQ ID NO.19、针对rrs基因C491T的SEQ ID NO.20及SEQ ID NO.21、针对rrs基因A513C/T的SEQ ID NO.22及SEQID NO.23~SEQ ID NO.24、和/或针对rrs基因C516T位点的SEQ ID NO.25及SEQ ID NO.26;微球;扩增引物。本发明所提供的rpsL和rrs基因SNP检测液相芯片的检测结果与测序法的吻合率高达100%,而所需要的时间远远低于常用的测序技术。
本发明公开了一种emb B基因突变检测特异性引物和液相芯片,所述液相芯片包括有ASPE引物,ASPE引物的特异性引物选自:针对codon 285位点的SEQ ID NO.18及SEQ IDNO.19、针对codon 306位点的SEQ ID NO.20及SEQ ID NO.21~25中的一种以上、针对codon330位点的SEQ ID NO.26及SEQ ID NO.27、针对codon 406的SEQ ID NO.28及SEQ IDNO.29~32中的一种以上、和/或针对codon 497位点的SEQ ID NO.33及SEQ ID NO.34;微球;扩增引物。本发明所提供的emb B基因突变检测液相芯片具的检测结果与测序法的吻合率高达100%,并具有很好的信号-噪声比。
本发明公开了一种PDGFRA基因突变检测液相芯片,主要包括有:5’端的tag序列和3’端针对突变位点的特异性引物组成的ASPE引物,所述特异性引物是:针对V561D位点的SEQ ID NO.8~SEQ ID NO.9、针对DIMH 842-845del缺失突变和/或IMHD 843-846del缺失突变的SEQ ID NO.10~SEQ ID NO.12、、和/或针对D842V位点的SEQ ID NO.13~SEQ ID NO.14;所述tag序列选自SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.7;分别包被有特异的anti-tag序列的、具有不同颜色编码的微球;扩增引物。本发明所提供的液相芯片的检测结果与测序法的吻合率高达100%。所制备的PDGFRA基因突变检测液相芯片具有很好的信号-噪声比,并可实现多个突变位点的并行检测。
本发明公开了一种c-KIT基因突变检测液相芯片,主要包括有:5’端的tag序列和3’端针对突变位点的特异性引物组成的ASPE引物,所述特异性引物是:针对AY502-503dup突变位点的SEQ ID NO.10和SEQ ID NO.11、针对V560G突变位点的SEQ ID NO.12和SEQ ID NO.13、针对T670I突变位点的SEQ ID NO.14和SEQ ID NO.15、和/或针对D816H/V突变位点的SEQ ID NO.16及SEQ ID NO.17和SEQ ID NO.18;所述tag序列选自SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.9;分别包被有特异的anti-tag序列的、具有不同颜色编码的微球;扩增引物。本发明所提供的液相芯片的检测结果与测序法的吻合率高达100%。所制备的c-KIT基因突变检测液相芯片具有很好的信号-噪声比,并可实现多个突变位点的并行检测。
本发明公开了一种rpoB基因突变检测液相芯片和特异性引物,液相芯片主要包括有:5’端的tag序列和3’端针对突变位点的特异性引物组成的ASPE引物,所述特异性引物是:SEQ IDNO.21及SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.23及SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.25及SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.27及SEQ ID NO.28~SEQ ID NO.31中的一种以上、SEQ ID NO.32及SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.34及SEQ ID NO.35~SEQ ID NO.36中的一种以上、SEQ ID NO.37及SEQ IDNO.38、和/或SEQ ID NO.39及SEQ ID NO.40;所述tag序列选自SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.20中的序列;分别包被有特异的anti-tag序列的、具有不同颜色编码的微球;扩增引物。本发明所提供的液相芯片的检测结果与测序法的吻合率高达100%。所制备的rpoB基因突变检测液相芯片具有很好的信号-噪声比,并可实现多个突变位点的并行检测。