本发明公开了一种染色体6q23区段多态性检测特异性引物和液相芯片,该液相芯片主要包括有:由5’端的tag序列和3’端的针对目的基因多态性位点的特异性引物序列组成的特异性引物,所述特异性引物序列分别选自:针对G107A的SEQ ID NO.15和SEQ ID NO.16、针对G301A的SEQ ID NO.17及SEQ ID NO.18、针对G103A的SEQ ID NO.19及SEQ ID NO.20、针对G219T的SEQ ID NO.21及SEQ ID NO.22、针对T74C的SEQ ID NO.23及SEQ ID NO.24、针对T163C的SEQ ID NO.25及SEQ ID NO.26、针对T135C的SEQ ID NO.27及SEQ ID NO.28中的一对以上;所述tag序列选自SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.14中的序列;微球,扩增引物。所制备的染色体6q23区段多态性检测液相芯片具有非常好的信号-噪声比,并且所设计的探针以及anti-tag序列之间基本上不存在交叉反应。
本发明公开了一种PIGU基因SNP检测液相芯片,主要包括有:每种由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成的ASPE引物,所述特异性引物序列为:针对野生型的SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.18和SEQ ID NO.19中的一条和针对突变型的SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.20和SEQ ID NO.21中的一条;有anti-tag序列包被的微球;扩增引物。本发明所提供的检测液相芯片的检测结果与测序法的吻合率高达100%,实现SNP位点的野生型和突变型并行检测。
本发明公开了一种CDKAL1基因多态性检测特异性引物和液相芯片,该液相芯片主要包括有:由5’端的tag序列和3’端的针对目的基因多态性位点的特异性引物序列组成的特异性引物,所述特异性引物序列分别选自:针对A107C的SEQ ID NO.9和SEQ ID NO.10、针对G323C的SEQ ID NO.11及SEQ ID NO.12、针对A210G的SEQ ID NO.13及SEQ ID NO.14、针对A75G的SEQ ID NO.15及SEQ ID NO.16中的一对以上;所述tag序列选自SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.8中的序列;微球,扩增引物。所制备的CDKAL1基因多态性检测液相芯片具有非常好的信号-噪声比,并且所设计的探针以及anti-tag序列之间基本上不存在交叉反应。
本发明公开了一种MYC基因SNP检测液相芯片,主要包括有:每种由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成的ASPE引物,所述特异性引物序列为:针对G203T位点野生型的SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.18和SEQ ID NO.19中的一条和针对G203T位点突变型的SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.20和SEQ ID NO.21中的一条;有anti-tag序列包被的微球;扩增引物。本发明所提供的检测液相芯片的检测结果与测序法的吻合率高达100%,实现SNP位点的野生型和突变型并行检测。
本发明公开了一种STAT4基因SNP检测特异性引物和液相芯片,主要包括有:每种由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物组成的ASPE引物,所述特异性引物为:针对G97C的SEQ ID NO.9及SEQ ID NO.10、针对G101A的SEQ ID NO.11及SEQ ID NO.12、针对G113A的SEQ ID NO.13及SEQ ID NO.14、针对G154T的SEQ ID NO.15及SEQ ID NO.16中的一对以上;有anti-tag序列包被的微球;扩增引物。本发明所提供的检测液相芯片的检测结果与测序法的吻合率高达100%,实现多态性位点的野生型和突变型并行检测。
本发明公开了一种KITLG基因SNP检测特异性引物和液相芯片,主要包括有:每种由5′端的tag序列和3′端针对目的基因突变位点的特异性引物组成的ASPE引物,所述特异性引物序列选自:SEQ ID NO.19及SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.21及SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.23及SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.25及SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.27及SEQ ID NO.28、SEQ IDNO.29及SEQ ID NO.30、SEQ ID NO.31及SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.33及SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.35及SEQ ID NO.36中的一对以上;有anti-tag序列包被的微球;扩增引物。本发明所提供的检测液相芯片的检测结果与测序法的吻合率高达100%,实现多态性位点的野生型和突变型并行检测。
本发明公开了一种CYP2C9基因SNP检测特异性引物和液相芯片,所述液相芯片包括有:由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变的特异性引物组成的ASPE引物,所述特异性引物分别为:针对G98A SNP位点的SEQ ID NO.17及SEQ ID NO.18、针对G173A SNP位点的SEQ ID NO.19及SEQ ID NO.20、针对C90T SNP位点的SEQ ID NO.21及SEQ ID NO.22、针对A162C SNP位点的SEQ ID NO.23及SEQ ID NO.24、针对C72T SNP位点的SEQ ID NO.25及SEQ ID NO.26、针对T102C SNP位点的SEQ ID NO.27及SEQ ID NO.28、针对A77G SNP位点的SEQ ID NO.29及SEQ ID NO.30、和/或针对A167C SNP位点的SEQ ID NO.31及SEQ ID NO.32;有anti-tag序列包被的微球;扩增引物。本发明所提供的CYP2C9基因SNP检测液相芯片的检测结果与测序法的吻合率高达100%。
本发明公开了一种IL-23R基因多态性检测特异性引物和液相芯片,该液相芯片主要包括有:由5’端的tag序列和3’端的特异性引物组成的ASPE引物,所述特异性引物序列选自:针对C214T的SEQ ID NO.9及SEQ ID NO.10、针对C235T的SEQ ID NO.11及SEQ ID NO.12、针对T82G的SEQ ID NO.13及SEQ ID NO.14、针对C53T的SEQ ID NO.15及SEQ ID NO.16中的一对以上;微球;扩增引物。所述的IL-23R基因多态性检测液相芯片具有非常好的信号-噪声比,并且所设计的探针以及anti-tag序列之间基本上不存在交叉反应,tag标签序列、anti-tag标签序列的选取以及tag标签序列与具体ASPE引物的结合,能够避免交叉反应,实现多个多态性位点的并行检测。
本发明公开了一种CYP2C19基因SNP检测特异性引物和液相芯片,所述液相芯片包括有:由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变的特异性引物组成的ASPE引物,所述特异性引物分别为:SEQ ID NO.25及SEQ ID NO.26、针对C194T SNP位点的SEQ ID NO.27及SEQ ID NO.28、SEQ ID NO.29及SEQ ID NO.30、SEQ ID NO.31及SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.33及SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.35及SEQ ID NO.36、SEQ ID NO.37及SEQ ID NO.38、SEQ ID NO.39及SEQ ID NO.40、SEQ ID NO.41及SEQ ID NO.42、SEQ ID NO.43及SEQ ID NO.44、SEQ ID NO.45及SEQ ID NO.46、和/或SEQ ID NO.47及SEQ ID NO.48;有anti-tag序列包被的微球;扩增引物。本发明所提供的CYP2C 19基因SNP检测液相芯片的检测结果与测序法的吻合率高达100%。
本发明公开了一种染色体9p21区段SNP检测液相芯片和特异性引物,主要包括有:ASPE引物对,每条ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对SNP位点的特异性引物组成,所述特异性引物是:针对染色体9p21区段G22115503C SNP的SEQ ID NO.17和SEQ ID NO.18、A22086055G SNP的SEQID NO.19和SEQ ID NO.20、A22114477G SNP的SEQ ID NO.21和SEQ ID NO.22、A22105026G SNP的SEQ ID NO.23和SEQ ID NO.24、A22105959G SNP的SEQ ID NO.25和SEQ ID NO.26、和/或A22088619G SNP的SEQ ID NO.27和SEQ ID NO.28;所述tag序列选自SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.14;分别包被有特异的anti-tag序列的、具有不同颜色编码的微球;扩增引物。本发明还公开了染色体9p21区段和KIF6基因SNP检测液相芯片。本发明所提供的检测方法与测序法的吻合率高达100%。所制备的KIF6基因和染色体9p21区段SNP检测液相芯片具有非常好的信号-噪声比。
本发明公开了一种ADRB1基因SNP检测特异性引物和液相芯片,所述液相芯片主要包括有:由5’端的tag序列和3’端针对SNP位点的特异性引物组成的ASPE引物,所述特异性引物是:针对A145G SNP位点的SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6、和/或针对C1165G SNP位点的SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8;分别包被有特异的anti-tag序列的、具有不同颜色编码的微球,所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.9~SEQ ID NO.12中的序列;用于扩增出具有A145G和/或C1165G的SNP位点的ADRB1基因目标序列的扩增引物。所述检测液相芯片与测序法的结果吻合率高达100%。所述特异性引物具有非常好的特异性,能准确区分各种型别的基因型。
本发明公开了一种GSTP1基因突变检测液相芯片,主要包括有:由5’端的tag序列和3’端针对突变位点的特异性引物组成的ASPE引物,所述特异性引物是:针对A313G突变位点的SEQ ID NO.11和SEQ ID NO.12、和针对C341T突变位点的SEQ ID NO.13和SEQ ID NO.14;所述tag序列选自SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.6;分别包被有特异的anti-tag序列的、具有不同颜色编码的微球;扩增引物。本发明所制备的GSTM1、GSTT1和GSTP1基因突变检测液相芯片具有非常好的信号-噪声比,并且所设计的探针以及anti-tag序列之间基本上不存在交叉反应,tag标签序列、anti-tag标签序列的选取以及tag标签序列与具体ASPE引物的结合,能够避免交叉反应,实现多个突变位点的并行检测。
本发明公开了一种CYP4F2基因SNP检测特异性引物和液相芯片,该液相芯片主要包括有:由5’端的tag序列和3’端针对目的基因SNP位点的特异性引物组成的ASPE引物,所述特异性引物是:针对G1297A SNP位点的SEQ ID NO.13和SEQ ID NO.14、和/或针对T34G SNP位点的SEQ ID NO.15和SEQ ID NO.16;微球;扩增引物。本发明还提供了一种CYP4F2和EPHX1基因SNP检测液相芯片,其除了具有CYP4F2基因SNP检测液相芯片的对应的组成外,还具有针对EPHX1基因的G357A、G19512990A、T337C和/或A416GSNP位点的ASPE引物对、微球以及扩增引物。所述检测液相芯片具有非常好的信号-噪声比,能够避免交叉反应,且可以实现多个SNP位点的并行检测。
本发明公开了一种SLCO1B1基因SNP检测特异性引物和液相芯片,该液相芯片主要包括有:ASPE引物对:每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对SNP位点的特异性引物组成,所述特异性引物是:针对T521C SNP位点的SEQ ID NO.11和SEQ ID NO.12、针对T89595C SNP位点的SEQ IDNO.13和SEQ ID NO.14、针对A388G SNP位点的SEQ ID NO.15和SEQ ID NO.16、针对C463A SNP位点的SEQ ID NO.17和SEQ ID NO.18、和/或针对A1929C SNP位点的SEQ ID NO.19和SEQ IDNO.20;所述tag序列选自SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.10;微球;扩增引物。本发明所提供的检测液相芯片与测序法的检测结果吻合率高达100%。所制备的SLCO1B1基因SNP检测液相芯片具有非常好的信号-噪声比。