本发明公开了来源于盐芥的基因EsH2A.3在调控植物耐盐性中的应用,属于分子生物学技术领域。基因EsH2A.3的cDNA序列如SEQ ID NO.1所示;其编码的蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。本发明从盐芥中分离得到一个组蛋白H2A基因EsH2A.3,并首次研究发现:基因EsH2A.3对于植物抵抗外界高盐胁迫中起到了重要的作用,是一个新的抗盐基因。植物一生都生活在各种各样的逆境条件中,可将基因EsH2A.3转化水稻、小麦、玉米等农作物,或者苹果、梨、杨树等木本植物,提高转基因植株的耐盐能力,进而提高其产量和品质,具有重大的经济效益和社会价值。