本发明属于生物技术领域,具体涉及一种利用多态性SSR引物鉴定韭菜品种的方法及引物及应用。本发明依据SSR分子标记技术检测重现性高,稳定性好的特点,对韭菜进行了转录组测序,通过对测序数据分析设计SSR引物,从这些引物中筛查出6对引物,所述引物包括SSR19、SSR38、SSR43、SSR61、SSR168、SSR374,上述引物对应的上下游核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1‑12所示,这些引物能有效鉴别本发明的8个韭菜品种,并建立快速的鉴定程序,既可以应用于韭菜资源研究中品种的鉴定,也为韭菜品种销售时追溯源头奠定了基础。