[发明专利]一种与猪肌肉生长性状相关的SNP分子标记及其应用有效
申请号: | 202110973368.6 | 申请日: | 2021-08-24 |
公开(公告)号: | CN113846169B | 公开(公告)日: | 2023-08-15 |
发明(设计)人: | 商鹏;张博;张健;王克君;段梦琪;韦明邦;张浩;朱新海 | 申请(专利权)人: | 西藏农牧学院 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 西安汇恩知识产权代理事务所(普通合伙) 61244 | 代理人: | 张伟花 |
地址: | 860000 西藏自*** | 国省代码: | 西藏;54 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 肌肉 生长 性状 相关 snp 分子 标记 及其 应用 | ||
本发明提供了一种与猪肌肉生长性状相关的SNP分子标记,SNP分子标记中包括9个与猪肌肉生长性状相关的连锁突变位点,还提供了其应用,用于鉴定猪肌肉生长性状。本发明的SNP分子标记中的与猪肌肉生长性状相关的连锁突变位点课用于对猪进行选择育种和对猪肌肉性状的鉴定。
技术领域
本发明属于分子遗传学技术领域,具体涉及一种与猪肌肉生长性状相关的SNP分子标记及其应用。
背景技术
猪肉是我国日常食用最多的肉类,同时在畜牧业生产中作为主体发展,随着人们生活水平的提高,对于猪肉的品质有较高的要求,对于其中的肌肉的食用,其中适当的肌内脂肪含量和肌纤维数量能显著改善其口感。在畜牧生产中,这种生长性状特性受到多种转录因子等的调控作用,在育种过程中,由于肌肉表观差异的分辨困难,使得对优质肉类的猪选育停留在浅层次的状态,而从基因组层面对其进行分析,根本上区分了不同类型的肌肉生长性状,分子标记的辅助选择,对育种方面有着重要意义。
发明内容
本发明所要解决的技术问题在于针对上述现有技术的不足,提供一种与猪肌肉生长性状相关的SNP分子标记及其应用,该SNP分子标记中的与猪肌肉生长性状相关的连锁突变位点课用于对猪进行选择育种和对猪肌肉性状的鉴定。
为解决上述技术问题,本发明采用的技术方案是:一种与猪肌肉生长性状相关的SNP分子标记,所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。
优选地,所述SNP分子标记中与猪肌肉生长性状相关的连锁突变位点包括9个:A-2367G、A-2290G、T-2249A、T-2247C、C-2204G、T-2159C、C-2094T、A-2045G和C-2035T;
所述A-2367G位于所述SNP分子标记的核苷酸序列的第904位碱基;
所述A-2290G位于所述SNP分子标记的核苷酸序列的第981位碱基;
所述T-2249A位于所述SNP分子标记的核苷酸序列的第1022位碱基;
所述T-2247C位于所述SNP分子标记的核苷酸序列的第1024位碱基;
所述C-2204G位于所述SNP分子标记的核苷酸序列的第1067位碱基;
所述T-2159C位于所述SNP分子标记的核苷酸序列的第1112位碱基;
所述C-2094T位于所述SNP分子标记的核苷酸序列的第1177位碱基;
所述A-2045G位于所述SNP分子标记的核苷酸序列的第1226位碱基;
所述C-2035T位于所述SNP分子标记的核苷酸序列的第1236位碱基;
所述SNP分子标记的核苷酸序列的第904碱基处存在A/G核苷酸多态性位点、第981处碱基存在A/G核苷酸多态性位点、第1022处碱基存在T/A核苷酸多态性位点、第1024处碱基存在T/C核苷酸多态性位点、第1067处碱基存在C/G核苷酸多态性位点、第1112处碱基存在T/C核苷酸多态性位点、第1177处碱基存在C/T核苷酸多态性位点、第1226处碱基存在A/G核苷酸多态性位点和第1236处碱基存在C/T核苷酸多态性位点,且为连锁位点。
上述9个SNP位点在基因组上完全连锁,只需检测A-2367G位点的基因型,就可得到其他8个位点基因型。
上述9个连锁突变原生型记为AA基因型,杂合型记为AG基因型,突变纯合记为GG基因型。
本发明还提供了上述的与猪肌肉生长性状相关的SNP分子标记的应用,所述SNP分子标记用于鉴定猪肌肉生长性状,该鉴定方法为:
S1、提取待检测猪的基因组DNA;
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