[发明专利]一种与猪肌肉生长性状相关的SNP分子标记及其应用

权利要求书

1.一种与猪肌肉生长性状相关的SNP分子标记的应用，其特征在于，所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示；所述SNP分子标记中与猪肌肉生长性状相关的连锁突变位点包括9个：A-2367G、A-2290G、T-2249A、T-2247C、C-2204G、T-2159C、C-2094T、A-2045G和C-2035T；

所述A-2367G位于所述SNP分子标记的核苷酸序列的第904位碱基；

所述A-2290G位于所述SNP分子标记的核苷酸序列的第981位碱基；

所述T-2249A位于所述SNP分子标记的核苷酸序列的第1022位碱基；

所述T-2247C位于所述SNP分子标记的核苷酸序列的第1024位碱基；

所述C-2204G位于所述SNP分子标记的核苷酸序列的第1067位碱基；

所述T-2159C位于所述SNP分子标记的核苷酸序列的第1112位碱基；

所述C-2094T位于所述SNP分子标记的核苷酸序列的第1177位碱基；

所述A-2045G位于所述SNP分子标记的核苷酸序列的第1226位碱基；

所述C-2035T位于所述SNP分子标记的核苷酸序列的第1236位碱基；

所述SNP分子标记的核苷酸序列的第904碱基处存在A/G核苷酸多态性位点、第981处碱基存在A/G核苷酸多态性位点、第1022处碱基存在T/A核苷酸多态性位点、第1024处碱基存在T/C核苷酸多态性位点、第1067处碱基存在C/G核苷酸多态性位点、第1112处碱基存在T/C核苷酸多态性位点、第1177处碱基存在C/T核苷酸多态性位点、第1226处碱基存在A/G核苷酸多态性位点和第1236处碱基存在C/T核苷酸多态性位点，且为连锁位点；

所述SNP分子标记用于鉴定猪肌肉生长性状，方法为：

S1、提取待检测猪的基因组DNA；

S2、对S1中所述待检测猪的基因组DNA进行PCR扩增，得到PCR产物；

所述PCR扩增的反应体系为： 2×Taq PCR Master Mix 25μL、待检测猪的基因组DNA 3μL、正向引物1μL、反向引物1μL、ddH₂O 20μL；

所述PCR扩增的反应程序为：95℃预变性5min；进行38个循环：95℃预变性30s，55℃梯度退火30s，72℃延伸50s；72℃延伸5min；

所述正向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示；所述反向引物的核苷酸序列如SEQID No.3所示；

S3、对S2中得到的PCR产物进行测序，用Chromas Pro软件将测序文件与如SEQ ID No.1所示的SNP分子标记的核苷酸序列进行比对分析，根据目的序列第433bp处判断待检测猪的基因型；

肌纤维数量GG型猪高于AG型，AG型高于AA型。