[发明专利]一种马氏珠母贝类胡萝卜素含量相关的Pm-SRB基因SNP分子标记及其应用

说明书

本发明涉及分子辅助育种技术领域，公开了一种马氏珠母贝类胡萝卜素含量相关的Pm‑SRB基因SNP分子标记及其应用。SNP分子标记位点如核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，在该序列第1102、1143、1154与1642处分别存在AG、AG、TC与GA突变，筛选与类胡萝卜素含量显著关联的Pm‑SRB基因SNP分子标记，选留基因型组合AATT/AATT的个体为育种亲本，培育富含类胡萝卜素含量的养殖新品系。本发明的方法提高了马氏珠母贝亲本筛选的准确性，可以获得类胡萝卜素含量高而且遗传稳定马氏珠母贝新品系。

技术领域

本发明涉及海水珍珠贝分子辅助育种技术领域，特别是一种马氏珠母贝类胡萝卜素含量相关的Pm-SRB基因SNP分子标记及其应用。

背景技术

类胡萝卜素通常是指C40的碳氢化合物和它们的氧化衍生物两大类色素的总称。类胡萝卜素色泽鲜亮、着色力强，已广泛应用于着色剂、饲料添加剂。除了作为功能食品外，还有抗氧化的功能，如清除氧自由基抗氧化延缓衰老等。近年来，人们把对类胡箩卜素的研究从高等植物、藻类与微生物方面逐渐转移到动物体身上并取得了一些进展。类胡萝卜素在动物体内起着重要生理作用的脂溶性有机化合物，有助于增强动物体的免疫力，其在预防癌症、心血管疾病、骨质疏松症及其他慢性疾病方面起着很重要的作用。

随着科学技术的发展，在类胡萝卜素代谢机制方面的研究不断深入。研究初步表明，海洋贝类体内各组织均含有丰富的类胡萝卜素，贝类的抗逆性与体内的类胡萝卜素含量存在明显相关性，如虾夷扇贝新品种“海大金贝”，与普通扇贝相比，该品种因富含类胡萝卜素而具有更良好的抗逆性。我们前期研究发现，马氏珠母贝体内类胡萝卜素含量存在明显差异，而且珍珠收获期类胡萝卜素含量高的个体成活率较高。因此，如何有效筛选与类胡萝卜素显著相关分子标记，获得类胡萝卜素含量高的基因型，为培育马氏珠母贝新品系提供指导。

发明内容

本发明的目的是提供一种马氏珠母贝类胡萝卜素含量相关Pm-SRB基因的SNP标记方法及其应用，通过利用马氏珠母贝Pm-SRB基因的一个与类胡萝卜素含量相关的单倍型SNP标记进行亲本筛选与鉴定。

为了实现上述目的，本发明所采用的技术方案如下：

一种马氏珠母贝类胡萝卜素含量相关的SRB基因SNP分子标记，包含：

第1个SNP分子标记，所述第1个SNP标记为碱基A或G，所述SNP标记位于核酸的第1102位，所述核酸具有SEQ ID NO:1所示核苷酸序列；

第2个SNP分子标记，所述第2个SNP标记为碱基A或G，所述SNP标记位于核酸的第1143位，所述核酸具有SEQ ID NO:1所示核苷酸序列；

第3个SNP分子标记，所述第3个SNP标记为碱基T或C，所述SNP标记位于核酸的第1154位，所述核酸具有SEQ ID NO:1所示核苷酸序列；

第4个SNP分子标记，所述第4个SNP标记为碱基G或A，所述SNP标记位于核酸的第1642位，所述核酸具有SEQ ID NO:1所示核苷酸序列。

一种马氏珠母贝类胡萝卜素含量相关的Pm-SRB基因SNP分子标记在马氏珠母贝选育亲本中应用。

进一步的，所述马氏珠母贝选育亲本是筛选类胡萝卜素含量高的亲本，用于繁育子代群体。

进一步的，一种马氏珠母贝类胡萝卜素含量相关的Pm-SRB基因SNP分子标记的应用，具体包括如下步骤：

(1)从基础群体选取性腺成熟的个体作为候选亲本，取样闭壳肌组织，提取基因组DNA；

(2)将提取得到的基因组DNA作为模板，利用引物进行PCR扩增，进行序列检测分析，确定候选亲本每个SNP位点的基因型；

(3)分析每个候选亲本的单倍型基因组合，筛选单倍型AATT的个体作为育种亲本。