[发明专利]一种细胞形态扫描区域选择方法有效
申请号: | 202110481520.9 | 申请日: | 2021-04-30 |
公开(公告)号: | CN113205498B | 公开(公告)日: | 2022-09-09 |
发明(设计)人: | 王志岗;贺环宇;李昕;高晓斌 | 申请(专利权)人: | 天津深析智能科技发展有限公司 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06T7/136;G06T7/155;G06T5/30;G06T7/62;G06T7/90 |
代理公司: | 天津市北洋有限责任专利代理事务所 12201 | 代理人: | 杜文茹 |
地址: | 300000 天津市滨海新区塘沽海洋科技园新*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 细胞 形态 扫描 区域 选择 方法 | ||
1.一种细胞形态扫描区域选择方法,其特征在于,在高分辨率细胞形态学自动扫描流程中,通过10倍物镜预扫得到若干张十倍图之后,首先估算每张十倍图中的有核细胞数和成熟红细胞数,计算区域面积大于设定阈值的空白区域轮廓,计算染色深度大于设定阈值且连通区域面积大于设定阈值的轮廓,然后按照成熟红细胞数从大到小的顺序选择区域,同时要避开所述的空白区域和染色深度大于设定阈值的区域,直到所选区域中的有核细胞数达到设定值,完成最优扫描区域的选择;具体包括如下步骤:
1)对预扫得到的每一张十倍图的各参数进行计算,包括:计算有核细胞数、计算成熟红细胞数、计算区域面积大于设定阈值的空白区域轮廓和计算染色深度大于设定阈值且连通区域面积大于设定阈值的轮廓;
2)寻找最优扫描区域
(1)将所有十倍图按坐标位置组成M列、N行的矩阵;
(2)将计算得到的成熟红细胞数、区域面积大于设定阈值的空白区域轮廓的面积和染色深度大于设定阈值且连通区域面积大于设定阈值的轮廓面积对应取值为B、C、D,计算每张十倍图评估值Q的函数为:
Q=k*B/(m*C+n*D)其中,k、m、n 为大于零小于1的常量;
Q值取值越高,图像质量越好;
(3)选出矩阵中,Q值最大的图作为当前选择区域;
(4)判断当前选择区域有核细胞总数T是否满足扫描需求的有核细胞个数C,其中T =C;如果满足需求或者已经覆盖矩阵中的所有十倍图区域,则当前选择区域就是最优扫描区域,结束;否则进入下一步;
(5)选出与当前选择区域相邻的上下左右区域中Q值最大的区域,将所述的当前选择区域合并到Q值最大的区域中,形成新的当前选择区域,返回第(4)步。
2.根据权利要求1所述的一种细胞形态扫描区域选择方法,其特征在于,步骤1)中所述的有核细胞数的计算方法具体如下:
(1.1)对十倍图进行通道分离,得到R、G、B三个通道的灰度图;
(1.2)根据有核细胞的特点,将B通道与G通道相减得到突出有核细胞的灰度图;
(1.3)通过三类别的最大类间方差法及一维最大熵方法对得到的灰度图计算阈值,取其中最大阈值对灰度图进行二值化;
(1.4)对二值化结果图进行设定尺寸的腐蚀操作,并去掉小于设定面积的连通区域;
(1.5)统计最终图中的连通区域个数即为估算的有核细胞数。
3.根据权利要求1所述的一种细胞形态扫描区域选择方法,其特征在于,步骤1)中所述的成熟红细胞数的计算方法如下:
(2.1)将十倍图的R通道反色;
(2.2)对在进行有核细胞数的计算中得到的二值化结果图进行设定尺寸的开运算,结果作为掩膜;
(2.3)将R通道反色图中对应掩膜的非零位置赋值为零,以排除有核细胞对成熟红细胞检测的干扰;
(2.4)进行霍夫圆检测,检测出圆的个数即识别出的成熟红细胞个数。
4.根据权利要求1所述的一种细胞形态扫描区域选择方法,其特征在于,步骤1)中所述的区域面积大于设定阈值的空白区域轮廓的计算方法如下:
(3.1)将十倍图转为灰度图;
(3.2)将灰度图的宽高都缩小为原图的1/10;
(3.3)利用大津阈值方法对缩小后的灰度图做二值化;
(3.4)对二值化结果图进行设定尺寸的腐蚀,并去掉小于设定面积的连通区域
(3.5)对去掉小于设定面积的连通区域的结果图进行相同尺寸的膨胀,并恢复原图尺寸;
(3.6)寻找恢复原图尺寸的结果图中的连通区域的外轮廓,即为大于设定阈值的空白区域轮廓。
5.根据权利要求1所述的一种细胞形态扫描区域选择方法,其特征在于,步骤1)中所述的染色深度大于设定阈值且连通区域面积大于设定阈值的轮廓计算方法如下:
(4.1)将十倍图转为灰度图并反色;
(4.2)将灰度图的宽高都缩小为原图的1/10;
(4.3)通过三类别的最大类间方差方法计算阈值,取其中最大值对缩小后的灰度图做二值化;
(4.4)对二值化结果图进行设定尺寸的腐蚀,并去掉小于设定面积的连通区域;
(4.5)对上去掉小于设定面积的连通区域的结果图进行相同尺寸的膨胀,并恢复原图尺寸;
(4.6)寻找恢复原图尺寸结果图中的连通区域的外轮廓,即为染色深度大于设定阈值且连通区域面积大于设定阈值的轮廓。
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