[发明专利]一种用于评价牛精液品质的遗传标记物及其应用

说明书

本发明属于牛的遗传标记制备技术领域，具体涉及一种与精液品质性状关联的遗传标记，该标记从牛FHL2基因中筛选得到，其序列为如SEQ ID NO.1所示的第648bp‑1170bp的核苷酸序列，在该序列第879位碱基r处发生一个T/G碱基突变，导致FHL2基因多态性。公开了牛FHL2基因promoter区的SNP分型检测技术，发现在SEQ ID NO.1所示的第879位碱基处T/G突变位点与平均采精量性状显著相关。本发明为牛繁殖性状标记辅助选择提供了新的遗传标记。

技术领域

本发明属于牛的标记辅助选择技术领域，具体涉及一种用于评价牛精液 品质的遗传标记物及其应用。

背景技术

随着冷冻精液以及同期发情-定时输精技术的广泛使用，优质种公牛的繁 殖能力获得了极大地展现，其遗传改良能力也得到了更大地发挥。大量研究 数据表明，种公牛的优劣对奶牛群体遗传改良至关重要，其占据了奶牛群体 遗传改良进展的70％。随着分子生物学的发展，分子标记技术的出现弥补了 基于表型选择的传统育种方法的不足，促进了育种效率和进程。

牛分子育种的研究和应用也在快速发展，发现了一些与精液品质性状有 关联的功能基因和基因类型。FSH基因通过其受体FSHR介导，在雄性动物生 精上皮发育和精子形成过程中发挥重要作用。FSHβ基因上游调控区的5个 SNPs与精液中精子浓度、精子畸形率以及顶体完整率显著相关(P0.05)。 FSHR基因5’UTR和第1外显子的突变可能与原精活力(P0.05)、顶体完整 率(P0.01)相关。此外，其他生殖激素相关基因存在的突变，也会导致精 液品质性状的改变，如，GnRH基因第2外显子的突变、LHR基因第9内含子 的突变以及AR基因的CAG重复长度和频数、其第4外显子的突变等。

目前，全基因组关联分析(GWAS)涉及牛生育能力的研究较少。据报 道，筛选出候选基因，如PRM1，PRM2，GnRHR，CD9，PDGFRβ，MARCH1 等与牛精液品质性状关联。Puglisi等利用Illumina BovineHD chip(777K)对 105头荷斯坦公牛进行分析，检测出多个与精子质量性状显著相关的SNPs位 点。Qin等利用GWAS鉴定出中国荷斯坦奶牛群中19个与精液品质性状显著相 关的SNPs位点以及8个新的候选基因。

LIM-only蛋白FHL2(Four and a half LIM domains 2)作为LIM-Only蛋白 家族的一员，在机体内多种组织中有表达(Günther et al 2005)。研究表明，FHL2可以参与早期性腺的分化。在前列腺癌早期，FHL2与AR表达量较低， 但在癌症中后期表达水平升高。同时FHL2不仅可以激活正常的AR，还能与 突变的AR互作，诱导恶性前列腺癌的发生。这都表明了FHL2可能在雄性生 殖中发挥重要作用。但目前没有关于FHL2是否影响精液品质性状的研究报 道，也没有能用评价牛精液品质的试剂盒。

发明内容

为了解决上述技术问题，本发明提供一种用于评价牛精液品质的遗传标 记物及其应用。

为实现上述目的，本发明采用以下的技术方案为：

一种用于评价牛精液品质的遗传标记物，该遗传标记物的核苷酸序列为 如SEQID NO.1所示的第648bp-1170bp，在SEQ ID NO.1所示片段内的第 879bp处的r为T/G碱基的核苷酸多态性位点。

如上所述用于评价牛精液品质的遗传标记物，在如SEQ ID NO.1所示片 段内的T879G位点为TT基因型或TG基因型，说明牛精液品质优良。

如上所述的遗传标记在牛精液品质性状辅助选择中的应用。

一种用于评价牛精液品质的检测试剂盒，其包括如SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5所示引物对。