[发明专利]一种用于肝癌诊断的circRNA标志物在审

专利信息
申请号: 201811062783.0 申请日: 2018-09-12
公开(公告)号: CN109161595A 公开(公告)日: 2019-01-08
发明(设计)人: 王佳谊;张骁;郭素素;乔永霞;孙奋勇;潘秋辉;吴棋;陈岩;邾国庆;杨月月 申请(专利权)人: 上海市第十人民医院
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12N15/113
代理公司: 上海卓阳知识产权代理事务所(普通合伙) 31262 代理人: 周春洪
地址: 200072 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 标志物 肝癌 肝癌诊断 高表达 肝癌患者血清 诊断标志物 非编码RNA 肝癌细胞 正常个体 血清 吸附 诊断 刺激 疾病 分析 发现
【说明书】:

本发明公开了一种用于肝癌诊断的circRNA标志物,所述circRNA标志物为circ_104075。本发明通过实验发现,circRNA_104075在肝癌患者血清中高表达,肝癌细胞中HNF4a正调节circRNA_104075的表达,circRNA_104075通过吸附mir‑582‑3p刺激YAP表达,circ_104075水平在肝癌病人中高于正常个体和其他疾病病人,肝癌中circ_104075特异性高表达。AUC‑ROC分析表明,与其他非编码RNA标志物相比,血清circ_104075诊断效能更高,因此circ_104075可作为肝癌新型诊断标志物。

技术领域

本发明涉及生物医药技术领域,具体地说,是一种用于肝癌诊断的circRNA标志物。

背景技术

肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是全世界第5大常见恶性肿瘤,高居男性和女性肿瘤死因的第2位和第6位。全球每年HCC新发病例超过6.2万例。肝癌起病隐匿、预后不佳,绝大多数就诊时已属中晚期,缺乏有效的根治性治疗手段。自2007年索拉非尼被批准用于晚期肝癌一线治疗以来,靶向治疗药物为进展期肝癌患者带来新的希望。然而迄今为止,仍然存在很多需要解决的问题,如索拉非尼仅能延长2-3个月晚期肝癌中位生存时间,能用于肿瘤基因治疗的基因太少,近10年里肝癌的靶向治疗药物研究近乎停滞不前。此外,近年来尽管肝癌的病因学相对明确,但其发病机制和所涉及到的信号通路、预后相关因素尚未充分明确,HCC目前仍缺乏有效的预测判断分子。因此,急需寻找指导HCC预测判断的新分子标记物。

基因组学研究表明,大约只有1%的基因可转录成有蛋白编码功能的RNA,而大部分则转录成无蛋白编码功能的RNA,即非编码RNA。其中,环状RNA(circRNA)是一类能够闭合成环的长链非编码RNA,在病毒、植物,古细菌中已经发现大量circRNA的存在。近年来,Norman E Sharpless等研究组通过高通量技术与生物信息学分析推测在哺乳类动物细胞中存在大量内源性circRNAs,并通过Northern blot、二维凝胶电泳和反向引物PCR等生化实验手段得到了证实。部分研究成果揭示了circRNAs可以通过消耗剪切小体、结合RNA聚合酶II以及吸附miRNA等方式,参与调控细胞生物行为中核心基因的表达。研究表明,circRNAs在多种肿瘤细胞中表达异常,提示其可能与肿瘤的发生发展密切相关。与线性RNA分子相比,circRNA作为生物分子标志物具有如下优势:(1)circRNA形成特殊的共价闭合环状结构,3’端没有多聚腺苷酸尾,不会被核酸外切酶R所酶切,因此稳定性高,便于样品的保存;(2)circRNA可以通过外泌体而进入血液、组织液及痰液中,便于取样;(3)circRNA长度多在200-400碱基,使用qPCR即可定量检测,可操作性强。

人们也在积极寻找能够作为肝癌标志物的circRNA,如中国专利CN 104152452A公布了hsa_circRNA_102032在肝癌的诊断、治疗及预后中的应用;中国专利CN105524924B公布了一种环状RNA circ-ZKSCAN1,发现在肝癌病人中circ-ZKSCAN1基因表达水平明显降低;中国专利CN107663539A公布了一种环状RNA circ-PTGR1基因及其表达产物作为诊断肝癌的标志物。然而关于circRNA_104075作为肝癌中的新型血清肿瘤标志物,目前还未见报道。

发明内容

本发明的第一个目的是,针对现有技术中的不足,提供检测circ_104075表达量的试剂的用途。

本发明的第二个目的是,提供一种肝癌诊断试剂盒。

本发明的第三个目的是,提供一种用于肝癌诊断的circRNA标志物。

本发明的第四个目的是,提供一种肝癌诊断基因芯片。

为实现上述第一个目的,本发明采取的技术方案是:

检测circ_104075表达量的试剂的用途,用于制备检测肝癌的诊断试剂或诊断试剂盒。

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