[发明专利]一种可视化生物信息分析流程的调试方法及系统

说明书

本发明公开了一种可视化生物信息分析流程的调试方法及系统，方法包括：获取生物信息分析流程所需信息要素，并且构建一个可视化生物信息分析系统；接收用户的选取指令，在生物信息分析流程的不同节点选取相应的代码进行调试；获取流程调试的参数信息，并且接收用户通过form表单在参数设置模块输入的相关参数信息；基于分析系统的创建与参数信息对应的流程；接收用户的调试指令，并且使得调试模块根据调试指令的不同，相应的使得创建的流程执行开始调试、暂停、重试、取消一系列操作。所述可视化生物信息分析流程的调试方法及系统将调试过程通过可视化方式展示出来并且提高整个调试过程的准确性和效率。

技术领域

本发明涉及计算机程序开发管理相关领域，特别是指一种可视化生物信息分析流程的调试方法及系统。

背景技术

随着基因检测的技术日渐成熟，相应的生物信息分析技术正渐渐从实验室走向商业化、工程化。在现有的技术中，多采用工作人员写脚本的方式去进行相关分析流程的调试，这样不仅会对生物信息分析人员要求比较高，必须要了解编程方面的技术，而且在具体操作时也很不方便，效率较低，具体体现如下：

首先，生物信息分析人员在进行流程的调试过程中，针对调试进度不能一目了然的查看，如果调试流程与设计流程的设计员不是同一个人的话，流程稍微复杂点，调试人员就不可能了解流程的相关进度，不仅无法快速有效实现调试，而且容易出现错误。其次，生信人员在采用写流程脚本的方式进行调试过程中，有可能因为参数设置的不合理等因素，需要暂停流程，调整完参数之后需要从中间某一个环节继续开始调试，面对这种情况，生信人员需要不断的调整程序脚本；而这种方式，流程并没有记录执行过哪些节点，生信人员要很清楚的了解这个流程以及目前流程运行情况，这样会很消耗生信人员的心智，而且很容易犯错。

因此，在实现本申请发热过程中，发明人发现现有技术至少存在以下缺陷：当前对于生物信息分析流程的调试难以做到高效、准确以及可视化，同时对于调试人员具有很高的业务要求，调试过程效率低下。

发明内容

有鉴于此，本发明的目的在于提出一种可视化生物信息分析流程的调试方法及系统，将调试过程通过可视化方式展示出来并且提高整个调试过程的准确性和效率。

基于上述目的本发明提供的可视化生物信息分析流程的调试方法，包括：

获取生物信息分析流程所需信息要素，并且基于获取的信息要素构建一个可视化生物信息分析系统；其中，所述生物信息分析系统包含可视化调试界面、参数设置模块以及调试模块；

接收用户的选取指令，在所述可视化调试界面中包含的生物信息分析流程的不同节点选取相应的代码进行调试；

获取流程调试的参数信息，并且接收用户通过form表单在参数设置模块输入的相关参数信息；

基于可视化生物信息分析系统创建与用户输入的参数信息对应的流程；

接收用户的调试指令，并且使得调试模块根据调试指令的不同，相应的使得创建的流程执行开始调试、暂停、重试、取消一系列操作。

可选的，所述接收用户的调试指令，并且根据调试指令的不同，相应的使得创建的流程执行开始调试、暂停、重试、取消一系列操作包括：

接收用户发出的开始调试指令使得生物信息分析流程启动调试过程；

实时获取当前可视化调试界面中显示的信息以及相应的分析结果；并相应的判断当前调试状况是否需要暂停；

若需要暂停，则用户发出暂停指令，相应的调节参数并且发出重试指令继续进行调试过程；

若不需要暂停，则继续运行直到运行结束。

可选的，还包括：基于所述可视化调试界面以及生物信息分析流程的执行相应的记录每个流程执行的节点以及用户执行的操作信息；