[发明专利]用于鹿的多态性微卫星DNA分子标记及其用途

说明书

本发明描述了用于鹿科动物的微卫星DNA分子标记。这些分子标记可用于鉴定等位基因多态性，鉴定相同或相关的鹿科动物，区分鹿科动物及研究种群中的遗传多样性。分子标记也可用于使用统计学方法的遗传和表型研究，例如，连锁分析、结合映射、连锁不平衡等。所述信息可用于植物的繁殖和/或选择。

技术领域

本发明涉及分子基因分型领域，具体而言，涉及用于鹿的多态性微卫星DNA分子标记及其用途。

背景技术

梅花鹿(Cervus nippon)主要分布于东亚，范围从西伯利亚到韩国、中国东部和越南；在日本等西太平洋岛屿也有分布。中国的梅花鹿主要分布在吉林省，而日本的梅花鹿主要分布于北海道。19世纪梅花鹿曾经被猎到几乎绝种，20世纪中开始立法保护，族群在1950年代到1980年代快速恢复。梅花鹿也被引进到澳大利亚、欧洲和美国。原先的目的是作为公园装饰用的动物，但现在许多变成野生。目前，分布于中国和日本的梅花鹿亚种已经被IUCN红色名录列为极危或濒危等级，我国的梅花鹿同时也是国家一级保护动物。

近年来，利用分子标记对物种的种群结构、遗传多样性、迁移、杂交、基因流及分子系统地理等的研究已经成为保护遗传学和分子生态学领域的热点。主要是因为它是划分种群保护管理单元和进化显著性单元、确定保护等级及制定优先保护管理措施的基础。目前，在关于梅花鹿的分子育种研究中，所应用的多态性微卫星分子标记大多数是借鉴已发布的牛的微卫星引物，只有少部分是通过传统的克隆方法得到的，且这些微卫星位点的多态性都不高，不能满足对梅花鹿进行保护、研究、管理及分子育种的要求。

有鉴于此，特提出本发明。

发明内容

本发明涉及微卫星DNA分子标记和用于扩增微卫星DNA分子标记的引物。本发明的微卫星DNA分子标记可用于分子基因分型和/或遗传指纹法，

根据本发明的一方面，本发明涉及一种鉴定鹿科动物样品基因型的方法，包括：

1)、提取所述鹿科动物样品的DNA；

2)、用选自下列的至少一个引物对扩增至少一种微卫星DNA分子标记：SEQ ID NO:30和31；SEQ ID NO:32和33；SEQ ID NO:34和35；SEQ ID NO:36和37；SEQ ID NO:38和39；SEQ ID NO:40和41；SEQ ID NO:42和43；SEQ ID NO:44和45；SEQ ID NO:46和47；SEQ IDNO:48和49；SEQ ID NO:50和51；SEQ ID NO:52和53；SEQ ID NO:54和55；SEQ ID NO:56和57；SEQ ID NO:58和59；SEQ ID NO:60和61；SEQ ID NO:62和63；SEQ ID NO:64和65；SEQ IDNO:66和67；SEQ ID NO:68和69；SEQ ID NO:70和71；SEQ ID NO:72和73；SEQ ID NO:74和75；SEQ ID NO:76和77；SEQ ID NO:78和79；SEQ ID NO:80和81；SEQ ID NO:82和83；SEQ IDNO:84和85以及SEQ ID NO:86和87；

或扩增各引物对对应的扩增产物的片段或变体；及

3)、鉴定所述鹿科动物样品中的至少一种多态等位基因。

在一些实施方式中，所述鹿科动物样品包括鹿科动物的毛发、体液、骨骼、粪便。

在一些实施方式中，所述鹿科动物样品的DNA的提取方法包括饱和苯酚-氯仿法、树脂提取法或磁珠提取法提取。

优选的，如上所述的方法，其中步骤2)包括用对应引物对扩增2种或更多微卫星DNA分子标记；

更优选的，其中步骤2)包括用对应引物对扩增3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28或29种微卫星DNA分子标记。