[发明专利]一种快速检测细菌多粘菌素耐药基因mcr‑1的LAMP引物组、试剂盒及检测方法在审
申请号: | 201710153044.1 | 申请日: | 2017-03-15 |
公开(公告)号: | CN106834506A | 公开(公告)日: | 2017-06-13 |
发明(设计)人: | 田国宝;黄曦;钟兰兰;曾昆姣;沈聪 | 申请(专利权)人: | 中山大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 广州嘉权专利商标事务所有限公司44205 | 代理人: | 胡辉 |
地址: | 510080 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 检测 细菌 多粘菌素 耐药 基因 mcr lamp 引物 试剂盒 方法 | ||
1.一种快速检测细菌多粘菌素耐药基因mcr-1的LAMP引物组,其包括一对内引物、一对外引物和一对环引物,其核苷酸序列分别如下所示:
内引物1:5’- GCGATGGGATAGGTTTGGCTGTGTTGCCGTTTTCTTGAC-3’;
内引物2:5’- TGCTGACGATCGCTGTCGGCACATAGCGATACGATGAT -3’;
外引物1:5’- TGATGCAGCATACTTCTGTG -3’;
外引物2:5’- GACCGTGCCATAAGTGTC -3’;
环引物1:5’- AAGGTAAGATTGGCGGTCG -3’;
环引物2:5’- CTACTGATCACCACGCTGTT -3’。
2.一种快速检测细菌多粘菌素耐药基因mcr-1的试剂盒,其特征在于:包括权利要求1所示的LAMP引物组。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:LAMP引物组中,内引物、外引物、环引物的摩尔比为:(6~8):(1~2):(3~4)。
4.根据权利要求2所示的试剂盒,其特征在于:还含有DNA聚合酶、LAMP反应液、显色剂、阳性对照和阴性对照。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于:DNA聚合酶为Bst DNA聚合酶。
6.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于:LAMP反应液含有:10 mM dNTP、10×ThermoPol反应缓冲液、150 mM MgSO4水溶液、5 mM 甜菜碱,四者的体积比为(6~8):(4~5):(2~3):(8~10)。
7.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于:显色剂为SYBR GREENⅠ。
8.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,阳性对照为含有细菌多粘菌素耐药基因mcr-1片段的质粒,阴性对照为DEPC水。
9.一种快速检测细菌多粘菌素耐药基因mcr-1的方法,包括如下步骤:
(1)提取待检样品DNA;
(2)利用LAMP引物组对待检样品DNA进行等温基因扩增反应;
(3)结果判断:反应结束后,在反应管中加入1~2µL显色剂,混匀后即可观察反应液的颜色:若呈现绿色,判定为阳性,若呈现橙色,判定为阴性;
上述方法所用的引物与试剂如权利要求1~8任一项所述;
上述方法用于非疾病的诊断与治疗。
10.根据权利要求9所述的方法,其特征在于:等温基因扩增反应的25μL反应体系含有:内引物各8 pmol/µL,外引物各1 pmol/µL,环引物各4 pmol/µL,反应液 12.5µL,DNA聚合酶8U,待检DNA 1~100 ng,用灭菌去离子水补齐到25µL;等温基因扩增反应的条件为:60~65℃反应55~65min。
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