[发明专利]一种快速检测细菌多粘菌素耐药基因mcr‑1的LAMP引物组、试剂盒及检测方法在审

专利信息
申请号: 201710153044.1 申请日: 2017-03-15
公开(公告)号: CN106834506A 公开(公告)日: 2017-06-13
发明(设计)人: 田国宝;黄曦;钟兰兰;曾昆姣;沈聪 申请(专利权)人: 中山大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 广州嘉权专利商标事务所有限公司44205 代理人: 胡辉
地址: 510080 广*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 快速 检测 细菌 多粘菌素 耐药 基因 mcr lamp 引物 试剂盒 方法
【权利要求书】:

1.一种快速检测细菌多粘菌素耐药基因mcr-1的LAMP引物组,其包括一对内引物、一对外引物和一对环引物,其核苷酸序列分别如下所示:

内引物1:5’- GCGATGGGATAGGTTTGGCTGTGTTGCCGTTTTCTTGAC-3’;

内引物2:5’- TGCTGACGATCGCTGTCGGCACATAGCGATACGATGAT -3’;

外引物1:5’- TGATGCAGCATACTTCTGTG -3’;

外引物2:5’- GACCGTGCCATAAGTGTC -3’;

环引物1:5’- AAGGTAAGATTGGCGGTCG -3’;

环引物2:5’- CTACTGATCACCACGCTGTT -3’。

2.一种快速检测细菌多粘菌素耐药基因mcr-1的试剂盒,其特征在于:包括权利要求1所示的LAMP引物组。

3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:LAMP引物组中,内引物、外引物、环引物的摩尔比为:(6~8):(1~2):(3~4)。

4.根据权利要求2所示的试剂盒,其特征在于:还含有DNA聚合酶、LAMP反应液、显色剂、阳性对照和阴性对照。

5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于:DNA聚合酶为Bst DNA聚合酶。

6.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于:LAMP反应液含有:10 mM dNTP、10×ThermoPol反应缓冲液、150 mM MgSO4水溶液、5 mM 甜菜碱,四者的体积比为(6~8):(4~5):(2~3):(8~10)。

7.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于:显色剂为SYBR GREENⅠ。

8.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,阳性对照为含有细菌多粘菌素耐药基因mcr-1片段的质粒,阴性对照为DEPC水。

9.一种快速检测细菌多粘菌素耐药基因mcr-1的方法,包括如下步骤:

(1)提取待检样品DNA;

(2)利用LAMP引物组对待检样品DNA进行等温基因扩增反应;

(3)结果判断:反应结束后,在反应管中加入1~2µL显色剂,混匀后即可观察反应液的颜色:若呈现绿色,判定为阳性,若呈现橙色,判定为阴性;

上述方法所用的引物与试剂如权利要求1~8任一项所述;

上述方法用于非疾病的诊断与治疗。

10.根据权利要求9所述的方法,其特征在于:等温基因扩增反应的25μL反应体系含有:内引物各8 pmol/µL,外引物各1 pmol/µL,环引物各4 pmol/µL,反应液 12.5µL,DNA聚合酶8U,待检DNA 1~100 ng,用灭菌去离子水补齐到25µL;等温基因扩增反应的条件为:60~65℃反应55~65min。

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