[发明专利]藻类培养中腔轮虫的快速定量检测qPCR方法有效

专利信息
申请号: 201611166619.5 申请日: 2016-12-16
公开(公告)号: CN106755392B 公开(公告)日: 2020-12-18
发明(设计)人: 龚迎春;李焕楠;胡强 申请(专利权)人: 国投生物科技投资有限公司;中国科学院水生生物研究所
主分类号: C12Q1/6851 分类号: C12Q1/6851;C12Q1/6893;C12Q1/06;C12N15/11
代理公司: 北京智为时代知识产权代理事务所(普通合伙) 11498 代理人: 王加岭;杨静
地址: 100034 北*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 藻类 培养 轮虫 快速 定量 检测 qpcr 方法
【权利要求书】:

1.一组引物组,其特征在于,包含三对引物,分别用于特异性扩增序列SEQ ID No.1-3,各对的上下游引物序列如下:

(1)CoI-1F:5’- TAATGTTAGGGGTTGCTGAT -3’;

CoI-1R:5’- ATGAAGTTACTAATAAAATAGCTGT -3’;

(2)CoI-2F:5’- TTATCTTCTATTCTGGATGCTG -3’;

CoI-2R:5’- TTGGTATAATACAGGATTGCC -3’;

(3)CoI-3F:5’- GTTCTCGTACAACAAAAATGAT -3’;

CoI-3R:5’- TTGGTATAATACAGGATTGCC-3’。

2.权利要求1所述引物组在藻类培养中腔轮虫的快速定量检测qPCR方法中的应用。

3.一种藻类培养中腔轮虫的快速定量检测qPCR方法,其特征在于,采用权利要求1所述的引物组,对待测样品的基因组DNA进行荧光定量PCR检测,采用权利要求1所述引物组中的任意一对 引物,将包含目的扩增片段的基因克隆到质粒PGEM-T中,构建重组质粒作为检测腔轮虫浓度的定量标准品,检测结果的判断方法如下:

(1)阳性对照的Ct值应小于36.0,阴性对照的Ct值应大于39.0;阳性标准品为重组质粒,阴性标准品为无菌双蒸水;

(2)若Ct值小于36.0,且呈现典型的扩增曲线,则判定为阳性结果,表明检测样品中含有腔轮虫;

(3)若Ct值大于39.0或无扩增信号,则判定为阴性结果,表明检测样品中无腔轮虫;

(4)若Ct值在36.0~39.0之间,则视为可疑结果,样品需重复检验一次;若结果仍在此范围内,则判定为阴性结果;

结果呈阳性的样品,根据其Ct值以及建立的定量标准曲线计算样品内的腔轮虫含量。

4.根据权利要求3所述的快速定量检测qPCR方法,其特征在于,所述引物组中各上游引物和下游引物的浓度均为10 μ mol/L,反应终浓度为0.25μ mol/L。

5.根据权利要求3所述的快速定量检测qPCR方法,其特征在于,所述荧光定量PCR采用的荧光染料为SYBR Green 染料,荧光检测波长为470-514 nm。

6.根据权利要求3所述的快速定量检测qPCR方法,其特征在于,所述荧光定量PCR的反应体系为: 2×的LightCycler 480 SYBR Green Ⅰ Master 10μL,10μ mol/L的上游引物0.5μL,10μ mol/L的下游引物0.5μL,DNA模板1μL,加水至总体积20μL。

7.根据权利要求3所述的快速定量检测qPCR方法,其特征在于,所述荧光定量PCR的反应程序为: 95℃5min,1个循环; 95℃10s、56℃20s、72℃30s,40个循环。

8.一种qPCR试剂盒,其包括权利要求1所述的引物组。

9.根据权利要求8所述的试剂盒,其特征在于:包括检测试剂和基因组DNA提取试剂。

10.根据权利要求9所述的试剂盒,其特征在于:所述检测试剂包括荧光染料、权利要求3所述的阳性标准品。

11.根据权利要求9所述的试剂盒,其特征在于:所述基因组DNA提取试剂包括Roche 的High Pure Template Preparation Kit试剂盒。

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