[发明专利]一种同时检测猪链球菌通用型和猪链球菌2型双重荧光定量PCR引物、试剂盒及方法有效
申请号: | 201610255090.8 | 申请日: | 2016-04-21 |
公开(公告)号: | CN105779625B | 公开(公告)日: | 2019-08-23 |
发明(设计)人: | 吴静波;南文金;彭国良;黄健强;胡鸿惠 | 申请(专利权)人: | 韶关学院 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6851;C12Q1/14;C12N15/11;C12R1/46 |
代理公司: | 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 | 代理人: | 许飞 |
地址: | 512005 广东省韶*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 同时 检测 链球菌 通用型 双重 荧光 定量 pcr 引物 试剂盒 方法 | ||
1.一种同时检测猪链球菌通用型和猪链球菌2型双重荧光定量PCR引物和探针,引物的核苷酸序列如下所示:
引物GDH-F:5’-GAGCTCTTCTCTACACTTGAGCC-3’(SEQ ID NO:1),
引物GDH-R:5’-CCATGGAACACGGAAGCTG-3’(SEQ ID NO:2),
引物CPS2J-F:5’-GATAGATGACGGTTCTTCAGATTCAT-3’(SEQ ID NO:4),
引物CPS2J-R:5’-CCATTTGGTAACCGGAAAAGTT-3’(SEQ ID NO:5);
探针的核苷酸序列如下所示:
探针GDH-P:5’-TTGAAGCACACCCAGAATACATCGAAGAA-3’(SEQ ID NO:3),
探针CPS2J-P:5’-TCTACCATCTTGCTCTGCGTATTCCA-3’(SEQ ID NO:6),
或者为探针的核苷酸序列的核苷酸互补序列。
2.根据权利要求1所述的引物和探针,其特征在于,所述探针序列5’端标记的荧光基团为FAM、HEX、VIC、CY5、TET中一种,探针序列3’端标记的淬灭基团为TAMRA、MGB、BHQ中一种;且探针GDH-P和CPS2J-P2的5’端标记的荧光基团不相同。
3.一种同时检测猪链球菌通用型和猪链球菌2型双重荧光定量PCR试剂盒,其特征在于:该试剂盒含有权利要求1或2所述的引物和探针。
4.一种同时检测猪链球菌通用型和猪链球菌2型双重荧光定量PCR方法,其特征在于:包括以下步骤:
1)从样品中提取病菌DNA;
2)以提取的DNA和阳性标准品DNA为模板,用权利要求1所述的引物对GDH-F、GDHR、CPS2J-F和CPS2J-R,及权利要求1或2所述探针GDH-P和CPS2J-P2进行双重荧光定量PCR扩增反应并收集荧光信号;
3)根据荧光信号的变化及强度,对待测样品中的猪链球菌和猪链球菌2型中的目标基因进行定性和定量分析;
上述方法用于非疾病的诊断和治疗。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:步骤2)中的双重荧光定量PCR扩增反应体系为:
2×Premix Ex Taq buffer12.5μl
10μM引物GDH-F0.5μl
10μM引物GDH-R0.5μl
5μM探针GDH-P1μl
10μM引物CPS2J-F0.5μl
10μM引物CPS2J-R0.5μl
5μM探针CPS2J-P1μl
模板DNA1μl
50×ROX Reference Dye0.25μl
无RNA酶水补至25μl。
6.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:步骤2)中双重荧光定量PCR扩增反应程序为:95℃预变性5min;95℃变性15s,56℃退火30s,循环40次。
7.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:步骤3)中所述结果分析的具体过程为:
1)定性分析:出现探针GDH-P5’端标记荧光的荧光扩增曲线说明猪链球菌通用型阳性,扩增出现探针CPS2J-P5’端标记荧光的荧光扩增曲线说明猪链球菌2型阳性;未出现荧光扩增曲线表明样品中不含有猪链球菌通用型和2型,为阴性;
2)定量分析:根据阳性标准品的标准曲线,将待测样品猪链球菌通用型或2型的检测CT值代入标准曲线公式,计算样品中含有的猪链球菌通用型或2型的基因拷贝数。
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