[发明专利]一种对未知来源个体进行非、欧、东亚群体遗传主成分析的方法和系统有效
申请号: | 201410361064.4 | 申请日: | 2014-07-25 |
公开(公告)号: | CN104212886A | 公开(公告)日: | 2014-12-17 |
发明(设计)人: | 李彩霞;魏以梁;叶健 | 申请(专利权)人: | 公安部物证鉴定中心 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京同立钧成知识产权代理有限公司 11205 | 代理人: | 刘芳 |
地址: | 100038 *** | 国省代码: | 北京;11 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 未知 来源 个体 进行 东亚 群体 遗传 成分 方法 系统 | ||
1.一种对未知来源个体进行非、欧、东亚群体遗传主成分析的方法,其特征在于,该方法包括:
1)提取未知来源个体的DNA;
2)获得所述DNA的27个非、欧、东亚群体特异性位点的基因型,所述27个非、欧、东亚群体特异性位点为:rs595961,rs2710684,rs260690,rs10496971,rs10497191,rs6444724,rs1586861,rs28777,rs13182883,rs1366220,rs159606,rs7752055,rs321198,rs366178,rs3780962,rs4244304,rs1498553,rs3825663,rs728404,rs1448485,rs7170869,rs1453858,rs2342747,rs4787040,rs881929,rs1197062和rs4789193;
3)将所述各特异性位点的基因型利用STRUCTURE软件获得群体遗传主成分分析结果。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,2)包括采用与所述27个特异性位点一一对应的27对扩增引物对其进行扩增以获得扩增产物的步骤;以及使用与所述27个特异性位点一一对应的27条延伸引物对所述扩增产物进行延伸以获得延伸产物的步骤。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述扩增引物为序列表中SEQ ID No.1至SEQ ID No.54的核苷酸序列;所述延伸引物为序列表中SEQ ID No.55至SEQ ID No.81的核苷酸序列。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,其中2)还包括在获得延伸产物后,使用遗传分析仪分析该延伸产物,以获得所述27个特异性位点的基因型的步骤。
5.一种对未知来源个体进行非、欧、东亚群体遗传主成分析的系统,其特征在于,所述系统包括DNA提取体系,复合扩增检测体系,数据获取体系;
所述DNA提取体系用于提取未知来源个体的DNA;
所述复合扩增检测体系用于获得所述DNA的27个非、欧、东亚群体特异性位点的基因型,所述27个非、欧、东亚群体特异性位点为:rs595961,rs2710684,rs260690,rs10496971,rs10497191,rs6444724,rs1586861,rs28777,rs13182883,rs1366220,rs159606,rs7752055,rs321198,rs366178,rs3780962,rs4244304,rs1498553,rs3825663,rs728404,rs1448485,rs7170869,rs1453858,rs2342747,rs4787040,rs881929,rs1197062和rs4789193;
所述数据获取体系用于由所述各特异性位点的基因型利用STRUCTURE软件获得群体遗传主成分分析结果。
6.根据权利要求5所述的系统,其特征在于,所述复合扩增检测体系用于采用与所述27个特异性位点一一对应的27对扩增引物对其进行扩增以获得扩增产物,并使用与所述27个特异性位点一一对应的27条延伸引物对该扩增产物进行延伸以获得延伸产物,并由获得的延伸产物得到未知来源个体的DNA的27个特异性位点的基因型。
7.根据权利要求6所述的系统,其特征在于,所述扩增引物为序列表中SEQ ID No.1至SEQ ID No.54的核苷酸序列,所述延伸引物为序列表中SEQ ID No.55至SEQ ID No.81的核苷酸序列。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于公安部物证鉴定中心,未经公安部物证鉴定中心许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201410361064.4/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。