[发明专利]一种对未知来源个体进行非、欧、东亚群体遗传主成分析的方法和系统有效

专利信息
申请号: 201410361064.4 申请日: 2014-07-25
公开(公告)号: CN104212886A 公开(公告)日: 2014-12-17
发明(设计)人: 李彩霞;魏以梁;叶健 申请(专利权)人: 公安部物证鉴定中心
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 北京同立钧成知识产权代理有限公司 11205 代理人: 刘芳
地址: 100038 *** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 未知 来源 个体 进行 东亚 群体 遗传 成分 方法 系统
【权利要求书】:

1.一种对未知来源个体进行非、欧、东亚群体遗传主成分析的方法,其特征在于,该方法包括:

1)提取未知来源个体的DNA;

2)获得所述DNA的27个非、欧、东亚群体特异性位点的基因型,所述27个非、欧、东亚群体特异性位点为:rs595961,rs2710684,rs260690,rs10496971,rs10497191,rs6444724,rs1586861,rs28777,rs13182883,rs1366220,rs159606,rs7752055,rs321198,rs366178,rs3780962,rs4244304,rs1498553,rs3825663,rs728404,rs1448485,rs7170869,rs1453858,rs2342747,rs4787040,rs881929,rs1197062和rs4789193;

3)将所述各特异性位点的基因型利用STRUCTURE软件获得群体遗传主成分分析结果。

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,2)包括采用与所述27个特异性位点一一对应的27对扩增引物对其进行扩增以获得扩增产物的步骤;以及使用与所述27个特异性位点一一对应的27条延伸引物对所述扩增产物进行延伸以获得延伸产物的步骤。

3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述扩增引物为序列表中SEQ ID No.1至SEQ ID No.54的核苷酸序列;所述延伸引物为序列表中SEQ ID No.55至SEQ ID No.81的核苷酸序列。

4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,其中2)还包括在获得延伸产物后,使用遗传分析仪分析该延伸产物,以获得所述27个特异性位点的基因型的步骤。

5.一种对未知来源个体进行非、欧、东亚群体遗传主成分析的系统,其特征在于,所述系统包括DNA提取体系,复合扩增检测体系,数据获取体系;

所述DNA提取体系用于提取未知来源个体的DNA;

所述复合扩增检测体系用于获得所述DNA的27个非、欧、东亚群体特异性位点的基因型,所述27个非、欧、东亚群体特异性位点为:rs595961,rs2710684,rs260690,rs10496971,rs10497191,rs6444724,rs1586861,rs28777,rs13182883,rs1366220,rs159606,rs7752055,rs321198,rs366178,rs3780962,rs4244304,rs1498553,rs3825663,rs728404,rs1448485,rs7170869,rs1453858,rs2342747,rs4787040,rs881929,rs1197062和rs4789193;

所述数据获取体系用于由所述各特异性位点的基因型利用STRUCTURE软件获得群体遗传主成分分析结果。

6.根据权利要求5所述的系统,其特征在于,所述复合扩增检测体系用于采用与所述27个特异性位点一一对应的27对扩增引物对其进行扩增以获得扩增产物,并使用与所述27个特异性位点一一对应的27条延伸引物对该扩增产物进行延伸以获得延伸产物,并由获得的延伸产物得到未知来源个体的DNA的27个特异性位点的基因型。

7.根据权利要求6所述的系统,其特征在于,所述扩增引物为序列表中SEQ ID No.1至SEQ ID No.54的核苷酸序列,所述延伸引物为序列表中SEQ ID No.55至SEQ ID No.81的核苷酸序列。

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