[发明专利]检测龋齿蛋白的质谱模型及构建方法有效
申请号: | 201310368422.X | 申请日: | 2013-08-22 |
公开(公告)号: | CN103483442A | 公开(公告)日: | 2014-01-01 |
发明(设计)人: | 张学记;马庆伟;李燕;刘晓霏;林燕 | 申请(专利权)人: | 向华 |
主分类号: | C07K14/47 | 分类号: | C07K14/47;G01N30/72 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 410128 湖南省长沙市*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 龋齿 蛋白 模型 构建 方法 | ||
1.用于检测龋齿特征蛋白的唾液特征蛋白组合,由表征质荷比为3324.8m/z、3186.2m/z、3195.8m/z的龋齿特征蛋白组成,其中氨基酸序列分别为SEQ ID No.1、SEQ IDNo.2、SEQ ID No.3,如下所示:
SEQ ID No.1:Lys-Met-Thr-Glu-Ala-Gln-Glu-Asp-Gly-Gln-Ser-Thr-Ser-Glu-Leu-Ile-Gly-Gln-Phe-Gly-Val-Gly-Phe-Tyr-Ser-Ala-Phe-Leu-Val-Ala-Asp-Lys-Val;
SEQ ID No.2:Lys-Ser-Ser-Ser-Tyr-Ser-Lys-Gln-Phe-Thr-Ser-Ser-Thr-Ser-Tyr-Asn-Arg-Gly-Asp-Ser-Thr-Phe-Glu-Ser-Lys-Ser-Tyr-Lys-Met-Ala;
SEQ ID No.3:Gln-Asp-Glu-Pro-Pro-Gln-Ser-Pro-Trp-Asp-Arg-Val-Lys-Asp-Leu-Ala-Thr-Val-Tyr-Val-Asp-Val-Leu-Lys-Asp-Ser-Gly-Arg-Asp-Tyr。
2.权利要求1所述的特征蛋白组合,其中当3324.8m/z、3186.2m/z、3195.8m/z的峰都下调表达时表示该特征蛋白在龋齿易感人群中均低表达。
3.用于检测龋齿特征蛋白的质谱模型,包括权利要求1和2所述的唾液特征蛋白。
4.一种用于检测龋齿易感人群的试剂盒,其包含权利要求1和2所述的唾液特征蛋白组合,或包含权利要求3所述的质谱模型。
5.权利要求1和2所述唾液特征蛋白组合,或权利要求3所述的质谱模型,质谱模型在制备诊断龋齿易感人群试剂中的用途。
6.制备权利要求3所述质谱模型的方法,包括如下步骤:
1)收集多例临床确诊的龋齿患者唾液和正常对照人员的唾液作为两组唾液标本,进行低温冷冻备用;
2)对唾液蛋白进行质谱前预处理;
3)对预处理过的两组唾液蛋白进行质谱检测读取,获得两组唾液多肽的指纹图谱;
4)对所有的龋齿患者和正常人唾液多肽的指纹图谱进行标准化处理,并收集数据;
5)对所得数据进行质控处理,筛选出具有下列质荷比峰的三个龋齿特征蛋白:3324.8m/z、3186.2m/z和3195.8m/z,对所述特征蛋白进行多肽序列测定,并根据这三个质荷比峰建立检测龋齿易感性筛查的质谱模型。
7.如权利要求5所述的方法,其特征在于,其中步骤2)预处理的方法包括使用磁珠纯化和稳定样品中的血清蛋白或多肽。
8.如权利要求5所述的方法,其中所述步骤3)采用WCX2芯片对两组血清蛋白进行吸附,并对结合在弱阳离子WCX2芯片上的两组血清蛋白进行读取,获得两组血清多肽的指纹图谱。
9.如权利要求5所述的方法,其中所述步骤5)所述的质控处理,保留出峰数量大于50的质谱 图谱数据,并采用Sigma血清的组内变异系数来保证实验的一致性,从而根据变异系数满足一致性的允许范围来进行筛选,所述变异系数为14.9%。
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