[实用新型]用于DNA测序仪的可二维调整的CCD相机支撑装置有效
申请号: | 201220238908.2 | 申请日: | 2012-05-24 |
公开(公告)号: | CN202631932U | 公开(公告)日: | 2012-12-26 |
发明(设计)人: | 任鲁风;王绪敏;李运涛;周晓光;袁丽娜;冯玉臣;秦奕;韩伟静;谷岚;滕明静;俞育德;于军 | 申请(专利权)人: | 中国科学院北京基因组研究所;中国科学院半导体研究所 |
主分类号: | G03B17/56 | 分类号: | G03B17/56;F16M11/42;F16M11/04;F16M11/18 |
代理公司: | 北京金信立方知识产权代理有限公司 11225 | 代理人: | 黄威;郭迎侠 |
地址: | 101318 北京*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 dna 测序仪 二维 调整 ccd 相机 支撑 装置 | ||
技术领域
本实用新型涉及DNA测序技术领域,具体涉及一种用于DNA测序仪的可二维调整的CCD相机支撑装置,用于支撑DNA测序仪上的CCD相机在相互垂直的两个方向上的运动。
背景技术
在DNA测序技术领域,焦磷酸测序技术(pyrosequencing),是由Nyren等人于1987年发展起来的一种新型的酶级联测序技术,其可重复性和精确性能与Sanger法DNA测序技术相媲美,而速度却大大提高。
焦磷酸测序技术是由4种酶催化的同一反应体系中的酶级联化学发光反应。焦磷酸测序技术的原理是:引物与模板DNA退火后,在DNA聚合酶(DNA polymerase)、ATP硫酸化酶(ATP sulfurylase)、荧光素酶(luciferase)和三磷酸腺苷双磷酸酶(Apyrase)四种酶的协同作用下,将引物上每一个dNTP的聚合与一次光信号的释放偶联起来,通过检测光的释放和强度,达到实时测定DNA序列的目的。焦磷酸测序技术的反应体系由反应底物、待测单链、测序引物和四种酶构成。反应底物为5’-磷酰硫酸(adenosine-5’-phosphosulfate,APS)和荧光素(luciferin)。
在每一轮测序反应中,反应体系中只加入一种脱氧核苷酸三磷酸(dNTP),如果它刚好能和DNA模板的下一个碱基配对,则会在DNA聚合酶的作用下,添加到测序引物的3’末端,同时释放出一个分子的焦磷酸(PPi)。在ATP硫酸化酶的作用下,生成的PPi可以和APS结合形成ATP,在荧光素酶的催化下,生成的ATP又可以和荧光素结合形成氧化荧光素,同时产生可见光。通过微弱光检测装置及处理软件可获得一个特异的检测峰,峰值的高低则和相匹配的碱基数成正比。如果加入的dNTP不能和DNA模板的下一个碱基配对,则上述反应不会发生,也就没有检测峰。反应体系中剩余的dNTP和残留的少量ATP在Apyrase的作用下发生降解。待上一轮反应完成后,加入另一种dNTP,使上述反应重复进行,根据获得的峰值图即可读取准确的DNA序列信息。
整体操作流程描述如下:DNA样品通过破碎后,应用建库试剂进行加接头、单链捕获、结合至微球、微乳液PCR扩增、破乳液,获得建立在微球上的DNA文库,应用加样板将文库和测序反应需要的酶等铺放至具有微反应池的测序芯片,测序芯片和测序试剂安装至主机上,通过控制计算机根据模块数量和位置启动测序程序,自动化进行测序反应,产生的数据传输至数据分析计算机,完成测序后应用计算分析软件进行图像处理、序列读出、质量分析、序列拼接等工作,最终得到DNA样本的序列信息。刻有微反应池的测序芯片由芯径25μm厚度2mm的光纤面板进行单面光纤芯层刻蚀得到,刻蚀深度40μm,芯片上共计约300万个微反应池,其中成像部分约120万个微反应池。微反应池测序芯片是测序反应的载体,载有测序模板的DNA Beads及各种测序反应用酶均位于刻有微反应池的测序芯片中。
测序芯片设置于测序芯片安装座内,测序过程中,在测序芯片上发生化学反应,产生可见光,通过CCD(Charge Couple Device)相机捕捉测序反应所产生的光信号,即可得到所需要的测序信息。测序芯片的用于进行测序反应的一侧设有很多微小的微反应池,测序芯片微反应池的边长为23μm,深度为25μm,测序芯片是透明的,CCD相机从测序芯片的另一侧读取测序反应产生的光信号。现有技术的DNA测序仪只有一个安装座,CCD相机只需要远离或靠近安装座即可,也就是说CCD相机只需要一维方向的运动。为了提高DNA测序仪的工作效率,在DNA测序仪上设有并列的多个安装座,每个安装座上分别安装有测序芯片,这样就可以同时进行多个测序反应,提高测序效率。为了使用一个CCD相机来获取在多个安装座内进行的测序反应的信息,CCD相机既要在多个安装座之间进行切换还要能沿直线靠近或远离安装座,也就是需要一种可二维调整的CCD相机支撑装置。
实用新型内容
针对现有技术存在的上述缺陷,本实用新型要解决的问题是,提供一种用于DNA测序仪的可二维调整的CCD相机支撑装置,使CCD相机既可沿直线靠近或远离安装座,又能在并列的多个安装座之间进行切换。
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