[发明专利]双齿围沙蚕热休克蛋白70基因序列及其克隆方法无效
申请号: | 201210563321.3 | 申请日: | 2012-12-21 |
公开(公告)号: | CN103882025A | 公开(公告)日: | 2014-06-25 |
发明(设计)人: | 张倩茹;魏树和;张靖宜;牟文燕;周启星 | 申请(专利权)人: | 中国科学院沈阳应用生态研究所 |
主分类号: | C12N15/12 | 分类号: | C12N15/12;C12N15/10;C07K14/435 |
代理公司: | 沈阳科苑专利商标代理有限公司 21002 | 代理人: | 周秀梅;李颖 |
地址: | 110164 辽宁省*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 双齿围沙蚕热 休克 蛋白 70 基因 序列 及其 克隆 方法 | ||
技术领域
本发明属于分子生物学中基因克隆领域,具体的说是一种双齿围沙蚕热休克蛋白70(HSP70)基因序列及其克隆方法。
背景技术
热休克蛋白(heat shock protein,HSP)是指细胞在应激原特别是环境高温诱导下所产生的一组蛋白质。HSP首先是在果蝇体内发现的。1962年,发现将果蝇的培养湿度从25℃提高到30℃(热休克环境温度升高),30分钟后就可在多丝染色体上看到蓬松现象(或称膨突puff),提示这些区带基因的转录加强并可能有某些蛋白质的合成增加。1974年,人们从热休克果蝇幼虫的唾液腺等部位分离到了6种新的蛋白质,即热休克蛋白。除环境高温以外,其他应激原如缺氧、寒冷、感染、饥饿、创伤、中毒等也能诱导细胞生成热休克蛋白。因此,热休克蛋白(HSP)又称应激蛋白(stress protein,SP),但习惯上仍称为HSP。近年研究表明:热休克蛋白的生成,不仅见于果蝇,而且普遍存在于从细菌至人类的整个生物界(包括植物和动物)。绝大部分生物细胞生成的HSP分子量都在80~110kD、68~74kD和18~30kD之间。作为一个具有多成员的庞大糖蛋白超基因家族,根据其同源程度及相对分子质量大小可分为HSP110、HSP90、HSP70、HSP60和小HSP(HSP25、HSP27、HSP28)五大家族。此外,还有一部分HSP是以相关糖蛋白来分类的,如糖相关蛋白94和糖相关蛋白7。不同分子量的热休克蛋白,在细胞内的分布也有所不同,例如,在酵母菌中发现的分子量为89kD的HSP分布于细胞浆中,而分子量为68kD、70kD、110kD的HSP却主要分布于细胞核或核仁区域。
热休克蛋白70是最为保守和重要的一个热休克蛋白家族,具有多种生物学功能,包括分子伴侣功能、参与免疫反应、抗细胞凋亡功能、抗氧化功能、提高细胞的应激耐受性、促进细胞增殖、参与细胞骨架的形成和修复等,其广泛的生物学功能使之成为当今生命科学研究的热点,因此,研究这类进化上非常保守的蛋白基因表达调控机制和相关的信号转导是非常重要的。
双齿围沙蚕(Perinereis aibuhitensis)属环节动物门多毛纲沙蚕科,作为潮间带地区的常见物种,是各种鱼类、甲壳类和海鸟的重要食饵。由于沙蚕位于水陆生态食物链的底部,能摄食底泥中的沉积物、有机碎屑和微生物等,此外,对重金属和某些工业有机污染物具有一定积累和消化作用,因此被认为是多毛类中耐污染能力较强的底栖生物。多毛类沙蚕可以很好地利用底质中的有机污染物和一些重金属转化为自身的生产力,它们作为海洋食物链中的一个分室既是生产单元,又能够净化底质,使系统内部的废弃物再利用和循环,增加环境生态效益,其体内必然存在某种解毒和防御机制,而在其中HSP家族基因是必不可少的研究对象。因此,研究沙蚕热休克蛋白基因为揭示和利用其解毒防御系统功能具有重要意义。
发明内容
本发明的目的在于提供一种双齿围沙蚕热休克蛋白70(HSP70)基因序列及其克隆方法。
为实现上述目的本发明采用的技术方案为:
一种双齿围沙蚕热休克蛋白70基因序列,双齿围沙蚕热休克蛋白70基因序列为SEQ ID NO.1中核苷酸序列所示。
双齿围沙蚕热休克蛋白70基因序列编码蛋白,双齿围沙蚕热休克蛋白70基因序列编码蛋白为SEQ ID NO.2中氨基酸序列所示。
双齿围沙蚕热休克蛋白70基因序列的克隆方法,首先从双齿围沙蚕组织中提取总RNA;而后采用下游外侧特异性引物HSP70-Outer-R(5’-AGTCTTGCCGATGTAAGCCT-3’)和下游内侧特异性引物HSP70-Inner-R(5’-TTGGCGTCGAAGACTGTGTT-3’)进行5’-RACE反应,克隆得到热休克蛋白70基因5’端序列;再利用反向引物HSP70-F进行RT-PCR反应,克隆得到热休克蛋白70基因3’端序列,反向引物HSP70-F:5’-GGTCAACCACTTCATTCAGG-3’;通过序列片段拼接矫正,最终获得热休克蛋白70基因核苷酸序列SEQ ID NO.1。
本发明具有如下优点:
1.采用本发明对双齿围沙蚕热休克蛋白70基因的成功克隆和测序,首次确定其全部编码序列和部分非编码序列,从而也弄清了它所编码的氨基酸序列,该序列可以用以设计引物再克隆该基因,也可以根据该序列或该序列所推导的氨基酸序列对该基因进行重组表达或基因转移。
2.双齿围沙蚕热休克蛋白70基因的成功克隆和测序,为进一步分析HSP70影响下生物抗逆能力,为HSP70其它功能的筛选及应用奠定了基础;
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