[发明专利]一种百合ANS基因及其克隆方法无效
申请号: | 201210301234.0 | 申请日: | 2012-08-23 |
公开(公告)号: | CN102864159A | 公开(公告)日: | 2013-01-09 |
发明(设计)人: | 张克中;崔金腾;王瑜;张睿鹂 | 申请(专利权)人: | 北京农学院 |
主分类号: | C12N15/53 | 分类号: | C12N15/53;C12N9/02;C12N15/10 |
代理公司: | 北京科亿知识产权代理事务所(普通合伙) 11350 | 代理人: | 汤东凤 |
地址: | 102206 北京市*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 百合 ans 基因 及其 克隆 方法 | ||
1.一种百合ANS基因,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。
2.一种百合ANS基因编码的蛋白质,其氨基酸序列如SEQ IDNO:2所示。
3.一种百合ANS基因克隆方法,其特征在于按下列步骤进行:
(1)提取以及纯化百合花瓣RNA,合成cDNA第一链;
(2)应用一对引物通过聚合酶链式反应对百合cDNA第一链进行扩增,所述引物为:
ANS-F1:TGGGGRGTSATGCAYATTGTGAACC
ANS-R1:TCCTTCGGCGGHTCGCRRAACACWGC
(3)应用3′RACE引物对聚合酶链式反应产物进行3′RACE克隆,据测序所得的ANS基因保守区序列设计3′RAC外引物和内引物:
3′GSP:ACTATCCCAAATGTCCGCAACC
3′NGSP:GCTCTACTATGGTGGCAAATGGGTC
(4)应用5′RACE引物对聚合酶链式反应产物进行5′RACE克隆,据测序所得的ANS基因保守区序列设计5′RAC外引物和内引物:5’GSP:GCCAATGTGGACGAGAAGCGAA
5’NGSP:CAGGTTGCGGACATTTGGGATAGTAGTT
(5)ANS基因cDNA全长克隆,用Seqman软件将所得到的保守序列、3’端序列和5’端序列进行拼接,得到A基因的cDNA全长序列,共1356个碱基,设计引物进行全长验证,引物序列如下:
A-forward:CCATTCTACTCCCATCAACC
A-reverse:TATTTCGTAATCCCCCTCTA。
4.如权利要求3所述的百合ANS基因克隆方法,其特征在于:
对百合cDNA第一链进行扩增的PCR反应条件:94℃预变性5min,94℃变性40sec,57.1℃退火30sec,72℃延伸40sec,35cycles,72℃延伸10min,4℃forever。
3’RACE克隆的outter PCR反应条件:94℃预变性5min,94℃变性40sec,54℃退火30sec,72℃延伸60sec,20cycles,72℃延伸10min,4℃forever。
3’RACE克隆的inner PCR反应条件:94℃预变性5min,94℃变性40sec,57.1℃退火30sec,72℃延伸60sec,30cycles,72℃延伸10min,4℃forever。
5’RACE克隆的outter PCR反应条件:94℃预变性5min,94℃变性40sec,59.9℃退火30sec,72℃延伸70sec,20cycles,72℃延伸10min,4℃forever。
5’RACE克隆的inner PCR反应条件:94℃预变性5min,94℃变性40sec,60.9℃退火30sec,72℃延伸70sec,30cycles,72℃延伸10min,4℃forever。
全长克隆的PCR反应条件:94℃预变性5min,94℃变性40sec,48.8℃退火30sec,72℃延伸80sec,35cycles,72℃延伸10min,4℃fofever。
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