[发明专利]一种用于基于焦磷酸原理的454高通量测序的emPCR方法无效
申请号: | 201210130266.9 | 申请日: | 2012-04-27 |
公开(公告)号: | CN102719528A | 公开(公告)日: | 2012-10-10 |
发明(设计)人: | 孟和;孙子奎;陈永灿 | 申请(专利权)人: | 上海派森诺生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 上海智信专利代理有限公司 31002 | 代理人: | 胡美强;沈利 |
地址: | 200231 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 基于 磷酸 原理 454 通量 empcr 方法 | ||
1.一种用于基于焦磷酸原理的454高通量测序中emPCR的方法,其包括步骤:
1)乳化油、emPCR扩增混合液和试剂准备;
2)DNA文库捕获;
3)乳化;
4)扩增;
5)磁珠回收;
6)DNA文库磁珠富集;
7)测序引物退火,即制得测序所用的emPCR产物;
其特征在于,步骤1)所述的emPCR扩增混合液包括下列各组分:emPCRAdditive,30.6%~43.0%(v/v);5×扩增液,18.4%~21.5%(v/v);扩增引物,2.0%~7.5%(v/v);emPCR酶混合液,2.6%~5.9%(v/v);PPiase,0.1%~0.3%(v/v);余量为水。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤1)所述的emPCR扩增混合液包括下列各组分:emPCR Additive,38.4%(v/v);5×扩增液,20.3%(v/v);扩增引物,4.8%(v/v);emPCR酶混合液,5.3%(v/v);PPiase,0.2%(v/v);余量为水。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的emPCR扩增混合液的总体积为930μL~980μL。
4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的emPCR扩增混合液的总体积为937μL,包括下列各组分:360μL emPCRAdditive;180~200μL 5×扩增液;35~55μL扩增引物;50μL emPCR酶混合液;2μL PPiase;余量为水。
5.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的emPCR扩增混合液的总体积为937μL,包括下列各组分:290μL超纯水;360μL emPCRAdditive;190μL5×扩增液;45μL扩增引物;50μLemPCR酶混合液;2μL PPiase。
6.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤4)所述扩增的反应程序为:
①90-95℃,3-6min;
②93-95℃,28-32s;
③57-59℃,4-5min;
④66-70℃,28-32s;
步骤②至④共45-55个循环;
⑤4-10℃保存。
7.如权利要求6所述的方法,其特征在于,所述扩增的反应程序中步骤②至④为:
②94-95℃,28-32s;
③57-58℃,4-5min;
④67-69℃,28-32s。
8.如权利要求6所述的方法,其特征在于,所述扩增的反应程序中步骤①为94℃,4min;步骤⑤为10℃保存。
9.如权利要求6所述的方法,其特征在于,所述扩增的反应程序为:
①94℃,4min;
②94℃,30s;
③58℃,4.5min;
④68℃,30s;
步骤②至④共50个循环;
⑤10℃保存。
10.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的高通量测序为基于焦磷酸原理的454高通量转录组测序。
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