[发明专利]一种用于基于焦磷酸原理的454高通量测序的emPCR方法无效

专利信息
申请号: 201210130266.9 申请日: 2012-04-27
公开(公告)号: CN102719528A 公开(公告)日: 2012-10-10
发明(设计)人: 孟和;孙子奎;陈永灿 申请(专利权)人: 上海派森诺生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 上海智信专利代理有限公司 31002 代理人: 胡美强;沈利
地址: 200231 上海市*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 用于 基于 磷酸 原理 454 通量 empcr 方法
【权利要求书】:

1.一种用于基于焦磷酸原理的454高通量测序中emPCR的方法,其包括步骤:

1)乳化油、emPCR扩增混合液和试剂准备;

2)DNA文库捕获;

3)乳化;

4)扩增;

5)磁珠回收;

6)DNA文库磁珠富集;

7)测序引物退火,即制得测序所用的emPCR产物;

其特征在于,步骤1)所述的emPCR扩增混合液包括下列各组分:emPCRAdditive,30.6%~43.0%(v/v);5×扩增液,18.4%~21.5%(v/v);扩增引物,2.0%~7.5%(v/v);emPCR酶混合液,2.6%~5.9%(v/v);PPiase,0.1%~0.3%(v/v);余量为水。

2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤1)所述的emPCR扩增混合液包括下列各组分:emPCR Additive,38.4%(v/v);5×扩增液,20.3%(v/v);扩增引物,4.8%(v/v);emPCR酶混合液,5.3%(v/v);PPiase,0.2%(v/v);余量为水。

3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的emPCR扩增混合液的总体积为930μL~980μL。

4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的emPCR扩增混合液的总体积为937μL,包括下列各组分:360μL emPCRAdditive;180~200μL 5×扩增液;35~55μL扩增引物;50μL emPCR酶混合液;2μL PPiase;余量为水。

5.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的emPCR扩增混合液的总体积为937μL,包括下列各组分:290μL超纯水;360μL emPCRAdditive;190μL5×扩增液;45μL扩增引物;50μLemPCR酶混合液;2μL PPiase。

6.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤4)所述扩增的反应程序为:

①90-95℃,3-6min;

②93-95℃,28-32s;

③57-59℃,4-5min;

④66-70℃,28-32s;

步骤②至④共45-55个循环;

⑤4-10℃保存。

7.如权利要求6所述的方法,其特征在于,所述扩增的反应程序中步骤②至④为:

②94-95℃,28-32s;

③57-58℃,4-5min;

④67-69℃,28-32s。

8.如权利要求6所述的方法,其特征在于,所述扩增的反应程序中步骤①为94℃,4min;步骤⑤为10℃保存。

9.如权利要求6所述的方法,其特征在于,所述扩增的反应程序为:

①94℃,4min;

②94℃,30s;

③58℃,4.5min;

④68℃,30s;

步骤②至④共50个循环;

⑤10℃保存。

10.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的高通量测序为基于焦磷酸原理的454高通量转录组测序。

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