[发明专利]抗HBV的化合物的筛选方法有效
申请号: | 201210024711.3 | 申请日: | 2012-02-03 |
公开(公告)号: | CN103243172A | 公开(公告)日: | 2013-08-14 |
发明(设计)人: | 左建平;南发俊;杨莉;童贤昆;张仰明;王桂凤;唐炜 | 申请(专利权)人: | 中国科学院上海药物研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/02;G01N33/68;G01N33/569 |
代理公司: | 北京金信立方知识产权代理有限公司 11225 | 代理人: | 朱梅;徐琳 |
地址: | 201203 上海*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | hbv 化合物 筛选 方法 | ||
技术领域
本发明属于分子生物学与生物医药技术领域,具体而言,本发明涉及以乙型肝炎病毒(HBV)核心蛋白C末端氨基酸序列为药物作用靶位点的药物筛选方法。
背景技术
慢性乙型病毒性肝炎感染是严重危害人类健康的全球性感染疾病。在中国,乙型肝炎病毒引起的肝脏疾病位列全国十大死因之一,严重影响了人们正常的工作和生活。目前,上市的小分子抗乙型肝炎病毒药物主要为核苷类药物,如拉米夫定、恩替卡韦等,尽管这些药物在抑制病毒复制上都卓有成效,但由于现有核苷类抗乙型肝炎病毒药物的作用靶点单一(HBV DNA聚合酶),长期使用存在的耐药突变等问题。因此,寻找不同于核苷类抗HBV药物作用机制的新靶点,研发治疗乙型病毒性肝炎新型药物,尤其是非核苷类小分子抗HBV药物,是重要和紧迫的任务。已报道的非核苷类小分子抗HBV活性化合物有:异芳香二氢嘧啶(HAP)系列化合物,代表性化合物BAY38-7690,它同核心蛋白的113-143位氨基酸残基作用而干扰核心蛋白的组装过程,导致核心蛋白单体在细胞内过度累积而被降解;疏水性荧光探针bis-ANS能与核心蛋白结合,使之形成非壳体化的大分子多聚体,误导核心蛋白的正常装配过程,造成病毒基因组复制缺陷;苯丙烯酰胺类化合物AT-61和AT-130能够促进核心蛋白的组装速率,使得pgRNA来不及被包装,从而使得HBV-DNA复制水平降低;塞菊芋黄素同系化合物8-1能特异性地干扰宿主细胞的核转录因子与HBV启动子的相互作用,下调病毒RNA的转录水平。
HBV核心蛋白C末端共计34个氨基酸,为鱼精蛋白样结构,其中有16个精氨酸,形成有3个SPRRR序列与4个精氨酸聚集区,为高碱性末端,可结合前基因组RNA与聚合酶复合物(pgRNA-Pol)启动核壳体包装。目前 尚未见有报道将核心蛋白C末端氨基酸作为药物作用靶点进行抗HBV药物的筛选。
重组DNA技术是分子生物学中常用的一种生物技术,是指将一种生物体(供体)的基因与载体在体外进行拼接重组,然后转入另一种生物体(受体)内,使之按照人们的意愿稳定遗传并表达出新产物或新性状的DNA体外操作程序,也称为分子克隆技术。本发明通过重组DNA技术构建多种真核表达质粒来表达C末端缺失、截短或突变的核心蛋白,确定核心蛋白C末端4个带正电荷的精氨酸富集区域(RRRDRGR、SPRRR、SPRRRR和SPRRRR)为关键靶点,以此筛选的化合物能有效的诱导形成空载病毒颗粒,从而抑制病毒复制。
发明内容
针对现有技术中的不足,本发明人进行了广泛深入的研究,并最终完成了本发明。
本发明的目的是提供一种抗HBV的化合物的筛选方法。
根据本发明的目的,本发明提供了一种抗HBV的化合物的筛选方法,其中,该方法以HBV核心蛋白C末端氨基酸序列为药物作用靶点来筛选抗HBV的化合物,所述HBV核心蛋白C末端氨基酸序列至少包含STLPETTVVRRRDRGR。
本发明中,优选地,所述HBV核心蛋白C末端氨基酸序列可为:
STLPETTVVRRRDRGRSPRRRTPSPRRRRSQSPRRRRSQSRESQC、
STLPETTVVRRRDRGRSPRRRTPSPRRRRSQ、
STLPETTVVRRRDRGRSPRRRTP或
STLPETTVVRRRDRGR。
具体地,所述方法包括以下步骤:
(a)通过PCR的方法构建含有HBV核心蛋白C末端氨基酸序列的真核表达质粒,其中,所述HBV核心蛋白C末端氨基酸序列至少包含STLPETTVVRRRDRGR。
(b)用步骤(a)中所得质粒瞬时转染肝癌细胞(Huh7细胞,HepG2细胞等细胞系,优选为Huh7细胞)4~6小时后给予筛选化合物处理48~96小时。
(c)药物处理后收集细胞,以非变性琼脂糖凝胶电泳来筛选可诱导异常空载HBV核心颗粒包装的化合物。
本发明中,优选地,所述步骤(b)中筛选化合物处理为:将转染的肝癌细胞或与筛选化合物共同培养,所述化合物的浓度可以根据需要而进行设定。
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