本发明公开了CaRAP2‑12基因及在调控辣椒果实中类胡萝卜素合成中的应用,属于基因工程技术领域。本发明克隆到调控辣椒果实类胡萝卜素合成的关键转录因子CaRAP2‑12,核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。本发明通过构建含有CaRAP2‑12基因的重组质粒和转基因工程菌,创制得到调控辣椒果实类胡萝卜素合成的转基因植株。利用本发明所述CaRAP2‑12基因,可丰富辣椒果实次生代谢的认知,深入了解辣椒果实品质形成特别是颜色形成的遗传机制,为实现辣椒果实选择性农艺性状育种提供了理论和实际参考基础。