本发明提供一种毛蚶热休克蛋白(90)‑‑一种新型海洋生物污染检测标记物,属于分子生物技术领域,该毛蚶热休克蛋白(90)基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,由该核苷酸序列编码的毛蚶热休克蛋白(90)氨基序列如SEQ ID NO.6所示,该毛蚶热休克蛋白(90)用作海洋污染的检测标记物。本发明蚶热休克蛋白(90)基因通过基因克隆技术克隆获得,利用毛蚶热休克蛋白(90)用作新型海洋生物污染检测标记物,该检测标记物特异性强,在分子水平上能够直接以生物体内靶细胞或靶分子为反应终点进行灵敏的生物学反应,对海洋污染物暴露和毒性效应有预警作用。