本发明公开了一鉴别黄颡鱼、瓦氏黄颡鱼及杂交黄颡鱼的引物、试剂盒及方法,所引物的序列如SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示。所述试剂盒包括上述引物和PCR反应液。本发明应用PCR和STR分型等组合技术筛选和研制出一种可快速、准确地鉴别黄颡鱼、瓦氏黄颡鱼及杂交黄颡鱼的微卫星引物和试剂盒,该试剂盒可服务于研究黄颡鱼的科研及推广单位、苗种生产企业(繁育场)及养殖户,一方面可用于鉴别三种黄颡鱼(黄颡鱼、瓦氏黄颡鱼及其杂交黄颡鱼)苗种,另一方面,可用于黄颡鱼、瓦氏黄颡鱼及其杂交黄颡鱼的种质标准制定。