本发明一种与木本植物硝态氮应答相关的miRNA及其应用,包括miRNA,所述miRNA为硝态氮调控木本植物根系构型重塑过程中上调的miRNA(Pc‑miR169b_R‑1),所述miRNA的靶基因为核转录因子α2(nuclear transcription factor Y subunitalpha2,PcNFYA2),所述miRNA在硝态氮处理过程中高表达,通过下调靶基因的表达,参与调控木本植物根系构型重塑过程,miRNA(Pc‑miR169b_R‑1)与木本植物调控植物根系构型重塑过程有很好的相关性,在木本植物根系重构方面发挥重要作用。