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[发明专利]基于SNP位点数据的系谱推断方法、装置及电子设备-CN202110624464.X在审
发明人：王宇哲;朱迪;胡晓湘;吴寒宇 -专利权人：中国农业大学
申请日： 2021-06-04 - 公布日： 2021-10-01 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：本发明涉及基于SNP位点数据的系谱推断方法、装置、电子设备及存储介质，该方法包括：获取待构建基因组系谱的育种群体及所述育种群体中每个个体的SNP数据；在所述育种群体中，基于每个目标子代样本与候选亲本的SNP数据，使用亲子鉴定方法，确定每个目标子代样本的目标亲本，从而推断出所述育种群体的基因组系谱。本发明通过使用SNP数据进行亲子鉴定，能够推断出育种群体的基因组系谱，从而得到育种群体的高质量的系谱记录。
基于 snp 数据系谱推断方法装置电子设备

[发明专利]一种对虾抗病性状的选育方法-CN202110914524.1有效
发明人：代平;栾生;孔杰;李旭鹏;孟宪红;隋娟;曹家旺;谭建;陈宝龙 -专利权人：中国水产科学研究院黄海水产研究所;邦普种业科技有限公司
申请日： 2021-08-10 - 公布日： 2022-08-23 - 主分类号： A01K61/59 文献下载
摘要：本发明公开了一种对虾抗病性状的选育方法，所述方法包括：构建对虾家系的测试群体和保种群体；对测试群体进行病原感染，获取每个死亡个体的个体存活时间；基于测试群体构建参考群体；获得参考群体的SNP分型数据；估计参考群体的个体基因组育种值；获得保种群体的SNP分型数据；基于参考群体的所述个体存活时间、参考群体共有SNP位点的分型数据和保种群体共有SNP位点的分型数据，估计保种群体的个体基因组育种值；根据保种群体的个体基因组育种值选择保种个体进行留种和配种
一种对虾抗病性状选育方法

[发明专利]一种利用凹壳虚拟指数法制备香港牡蛎凹壳新品系的方法-CN202010086263.4有效
发明人：肖述;喻子牛;张跃环;向志明 -专利权人：中国科学院南海海洋研究所
申请日： 2020-02-11 - 公布日： 2021-03-09 - 主分类号： A01K61/54 文献下载
摘要：包括以下步骤：1)建立深凹壳型香港牡蛎的基础育种群体；2)构建凹壳虚拟指数计算方法；3)从各基础育种群体按照加权指数法进行群体选育构建F1代核心育种群体；4)运用加权指数法从每个核心群体筛选一定数量凹壳虚拟指数值最高的雌、雄牡蛎建立F2代半同胞家系；5)用聚合指数值最高的亲本杂交获得F3代家系；6)利用不同群体来源的F3，根据其聚合指数值高低筛选，再次择优聚合杂交获得F4代家系；7)从F4代家系运用截头选育(10％选择压选择和组合亲本
一种利用虚拟指数法制香港牡蛎凹壳新品系方法

[发明专利]华西牛基因组选择方法-CN202010192316.0有效
发明人：李俊雅;朱波;高会江;高雪;张路培;徐凌洋;陈燕;蔡文涛 -专利权人：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
申请日： 2020-03-18 - 公布日： 2020-10-16 - 主分类号： G16B20/30 文献下载
摘要：本发明公开了华西牛基因组选择方法，要解决的是现有肉牛育种群制种供种能力不足的问题。本发明的具体步骤如下：步骤一，构建参考群体并且测定经济性状；步骤二，对参考群体进行基因分型并且对数据进行处理和质量控制；步骤三，进行基因型数据填充，得到测序数据，然后进行QTL位点的筛选；步骤四，计算参考群体中各个性状的全部SNP标记的效应值；步骤五，得到候选群体基因组育种值，依据每个性状的基因组估计育种值计算个体的综合选择指数。本发明的目的是建立基于基因组选择技术的高效优质华西牛选育方法，全面提高我国肉牛种群选择效率，大幅节约育种成本，为优质华西牛的培育提供分子育种方法，推动肉牛种业的快速发展。
华西基因组选择方法

[发明专利]一种三疣梭子蟹抗副溶血弧菌新品系选育方法-CN202210925528.4有效
发明人：高保全;吕建建;孟宪亮;刘萍;李建 -专利权人：中国水产科学研究院黄海水产研究所
申请日： 2022-08-03 - 公布日： 2023-05-16 - 主分类号： A01K61/59 文献下载
摘要：本发明公开了一种三疣梭子蟹抗副溶血弧菌新品系选育方法，属于水产育种领域，收集三疣梭子蟹“黄选1号”新品种，雌蟹抱卵、排幼，幼体发育至II期幼蟹时，计算II期幼蟹副溶血弧菌72h半致死浓度，然后利用半致死浓度副溶血弧菌溶液胁迫II期幼蟹；收集存活个体，浸泡脱毒，转移至室外养殖，构建核心育种群体；同步建立浸泡脱毒处理的野生对照组；180日龄时，3％‑5％选择压力下，进行核心育种群体已交尾雌蟹留种。对留种雌蟹所生产的II期幼蟹，利用半致死浓度副溶血弧菌溶液胁迫72h；收集存活个体，经脱毒后，构建育种核心育种群体，180日龄时，进行选育、留种。
一种梭子蟹溶血弧菌品系选育方法

[发明专利]一种肋骨数基因的分子标记辅助选择育种方法-CN201610514858.9在审
发明人：杨明;吴珍芳;王青来;蔡更元;曾海玉;王建兰 -专利权人：广东温氏食品集团股份有限公司
申请日： 2016-06-30 - 公布日： 2016-09-28 - 主分类号： G06F19/20 文献下载
摘要：本发明公开了一种肋骨数基因的分子标记辅助选择育种方法，包括步骤：分析肋骨数在配套系商品肉猪中的表型变异系数、基因变异程度以及分析判断配套肉猪群体中肋骨数基因型分子育种选择与常规选育经济利益是否一致，评估种猪改良潜力；分析各核心育种群的肋骨数基因频率分布情况，分析判断核心育种群体肋骨数基因的分子选育与现场实践选育的目标是否一致，评估各品系核心育种群开展肋骨数基因辅助选择育种的可行性；制定适宜的分子标记辅助方法；建立有效的应用跟踪方法本发明的方法可使多肋骨数基因分子标记辅助选择与现场传统育种有机结合，建立符合企业需求、可操作性强、针对性强的肋骨数基因分子育种方法，快速提高育种效率，兼顾企业效益。
一种肋骨基因分子标记辅助选择育种方法

[发明专利]一种油菜隐性核不育临时完全保持系的选育方法-CN201410406809.4有效
发明人：吴新杰;陈凤祥;胡宝成;李强生;江莹芬;荣松柏;梅新全 -专利权人：安徽省农业科学院作物研究所
申请日： 2014-08-18 - 公布日： 2014-12-03 - 主分类号： A01G7/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种油菜隐性核不育临时完全保持系的选育方法，本发明无需借助测交和分子标记技术，从杂合型不育株自交后代可育株群体中即可选育出隐性核不育临时完全保持系；本发明用于隐性核不育临时完全保持系选育，重点关注育种群体中不育株是否有杂合型不育株，而传统选育方法重点关注育种群体中可育株是否有临时完全保持系基因型，受关注群体易于识别，范围大大缩小，选育方法简单，操作简便，结果可靠。
一种油菜隐性不育临时完全保持选育方法

[发明专利]一种三疣梭子蟹耐高盐新品系选育方法-CN202311035494.2在审
发明人：高保全;隋延鸣;任宪云;刘萍;李健 -专利权人：中国水产科学研究院黄海水产研究所
申请日： 2023-08-17 - 公布日： 2023-10-24 - 主分类号： A01K61/59 文献下载
摘要：本发明公开了一种三疣梭子蟹耐高盐新品系选育方法，属于水产育种领域，三疣梭子蟹幼体发育至II期幼蟹时，计算其高盐度海水72h半致死浓度，利用该盐度海水胁迫II期幼蟹；收集存活个体，构建核心育种群体；同步建立野生对照组；养殖至80日龄时，计算80日龄半成蟹高盐度海水72h半致死浓度，然后利用该盐度海水胁迫80日龄半成蟹，进行耐高盐能力测试；养殖至180日龄成蟹时，3％选择压力下，进行核心育种群体交尾雌蟹留种。对留种雌蟹所生产的II期幼蟹，利用半致死浓度高盐度海水胁迫72h；收集存活个体，构建育种核心育种群体，养殖至80日龄半成蟹时，进行耐高盐能力测试；养殖至180日龄成蟹时，进行选育、留种。
一种梭子蟹耐高盐新品系选育方法

[发明专利]一种提高水产动物全基因组选择育种效率的方法-CN201911196722.8有效
发明人：李富花;于洋;罗正;相建海 -专利权人：中国科学院海洋研究所
申请日： 2019-11-29 - 公布日： 2023-06-20 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：本发明公开了一种适合水产的动物的全基因组选择育种方法，具体地，对育种基础群或核心群个体的进行高密度SNP分型，并测定其目标性状的表型值，利用SNP分型数据和表型数据进行全基因组关联分析(GWAS)分析，利用筛选出的最优标记组合对候选群体或者下一代育种群体进行SNP分型，使用GBLUP、BayesB或者ssGBLUP等方法对候选群体或者下一代育种群体进行育种值预测，可以显著提高预测的准确性。
一种提高水产动物基因组选择育种效率方法

[发明专利]序列指导的分子育种方法-CN200880024977.X无效
发明人： S·多森;F·董;F·阿查德;S·埃辛顿;N·陶;Z·玛卡丁 -专利权人：孟山都技术公司
申请日： 2008-06-09 - 公布日： 2010-08-11 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明提供利用直接核酸序列信息提高植物种质的育种方法和组合物。所述方法描述了植物育种群体的种质中优选的核酸序列的鉴定和积累。
序列指导分子育种方法

[发明专利]一种鱼虾育种群体的留种和配种方法-CN201210342659.6无效
发明人：栾生;孔杰;罗坤;孟宪红;王伟继;张天时 -专利权人：中国水产科学研究院黄海水产研究所
申请日： 2012-09-14 - 公布日： 2013-01-02 - 主分类号： A01K61/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种鱼虾育种群体的留种和配种方法，包括下述步骤：获取选择指数；在限定的共亲系数下、根据家系选择指数从高到低依次选择一定数量的家系作为留种家系；在留种家系内根据个体选择指数从高到低依次选择一定数量的雄性个体和雌性个体作为留种个体在限定的共亲系数下，根据家系选择指数从高到低依次从留种家系中选择父本/母本家系及其配对母本/父本家系；根据个体选择指数从高到低将父本个体与相应的母本个体交配，建立父系/母系家系交配组，所有交配组构成下一世代育种群体本发明依据选择指数和共亲系数对育种群体的留种和配种过程进行控制，有效提高了目标性状的遗传进展。
一种鱼虾育种群体留种配种方法

[发明专利]一种评估花鲈生长和抗性性状综合育种值的方法及应用-CN202310065413.7在审
发明人：李昀;张冲;张永航;温海深;齐鑫 -专利权人：中国海洋大学三亚海洋研究院
申请日： 2023-01-30 - 公布日： 2023-05-05 - 主分类号： C12Q1/6888 文献下载
摘要：本发明涉及动物遗传育种领域，本发明提供了一种评估花鲈生长和抗性性状综合育种值的方法及应用，所述方法包括：测量参考群体的生长性状和抗性性状；对参考群体进行全基因组重测序及SNP分型；针对生长性状和抗性性状进行全基因组关联分析，鉴定与生长性状和抗性性状相关的SNP位点；基于不同的SNP标记数量建立全基因组选择模型；基于最佳全基因组选择模型计算参考群体和验证群体的基因组育种值；根据参考群体和验证群体的基因组育种值计算综合育种值本发明建立了评估花鲈生长性状和抗性性状协同选育的综合育种值的方法，通过对候选亲鱼的综合育种值进行评估可以挑选出兼具生长和抗性优势的核心育种群体，大大缩短育种年限，具有广阔的应用前景。
一种评估生长抗性性状综合育种方法应用

[发明专利]一种保护较高ALV阳性率的地方鸡保种群群体遗传多样性的方法-CN202310599325.5在审
发明人：张会永;韩威;李国辉;殷建玫;薛倩;周成浩;蒋一秀;朱云芬;俞燕 -专利权人：江苏省家禽科学研究所
申请日： 2023-05-25 - 公布日： 2023-07-18 - 主分类号： A01K67/02 文献下载
摘要：本发明公开了一种保护较高ALV阳性率的地方鸡保种群群体遗传多样性的方法，涉及家禽养殖技术领域。所述方法包括以下步骤：(1)剔除待净化群体中不产蛋，以及老弱病残的个体，得到F0世代育种群；(2)所述F0世代育种群经过四个世代的自繁，获得F3世代；在步骤(2)中，所述自繁采用输混精的方式进行，即选取本发明提供的方法，经过4个世代的自繁，即可实现将禽白血病病毒的阳性率由为30～60％，降为6％以下，从而能够最大限度地保留地方鸡保种群群体遗传多样。
一种保护 alv 阳性地方种群群体遗传多样性方法

[发明专利]一种带有MSTN基因分子育种标记的中华绒螯蟹选育群体构建方法-CN201710787832.6在审
发明人：王军;陈义培;吴廉;王成辉 -专利权人：上海海洋大学
申请日： 2017-09-04 - 公布日： 2018-05-04 - 主分类号： C12Q1/6888 文献下载
摘要：本发明公开了一种MSTN基因分子育种标记，其是MSTN基因的第三外显子序列上的三个单核苷酸变异位点，以起始密码子为起点，分别为C714T、G729A、和G753T。本发明是根据分子标记辅助育种的理论技术要求，在中华绒螯蟹群体中筛选出与生长性状（如体重）紧密关联的MSTN基因的育种标记，并在中华绒螯蟹的育种群体中筛选和构建带有MSTN育种分子标记的中华绒螯蟹选育群体为开展中华绒螯蟹的分子标记辅助育种奠定基础和提供参考。
一种带有 mstn 基因分子育种标记中华绒螯蟹选育群体构建方法

[发明专利]一种耐受低盐的脊尾白虾品系育种方法-CN202210066478.9有效
发明人：张年国;周裕华;侯文杰;刘本伟;周文玉;潘桂平;毕浩;顾利琴 -专利权人：上海市水产研究所（上海市水产技术推广站）
申请日： 2022-01-20 - 公布日： 2023-08-01 - 主分类号： A01K61/59 文献下载
摘要：本发明公开了一种耐受低盐的脊尾白虾品系育种方法，属于水产动物遗传育种技术领域，包括如下步骤：(1)基础育种群引进；(2)核心育种群构建；(3)F1代家系建立；(4)F1代苗种培育；(5)低盐胁迫养殖筛选本发明选用不同来源野生群体为基础群体，通过低盐耐受选育，使培育出的新品系生长速度快、低盐耐受力强，适合在江河地区养殖推广；该育种方法简单实用，可操作性强，经过多代选育，可培育出性状优良的脊尾白虾低盐良种
一种耐受低盐脊尾白虾品系育种方法

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