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[发明专利]一种基于XGBoost的癌旁组织中DNA甲基化预测方法-CN202210837114.6在审
发明人：马宝山;刘玉;张树正;李奥;郭悦吉;王赟杰 -专利权人：大连海事大学
申请日： 2022-07-15 - 公布日： 2022-11-01 - 主分类号： G16B20/30 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于XGBoost的癌旁组织中DNA甲基化预测方法，包括获取癌组织、癌旁组织甲基化数据集，构建癌组织、癌旁组织训练矩阵以及癌组织、癌旁组织测试矩阵；获取癌旁组织训练矩阵中所有CpG位点的相关CpG位点集合，构建训练特征数据集；获取癌旁组织测试矩阵中所有CpG位点的相关CpG位点集合，构建测试特征数据集；构建XGBoost模型，通过训练特征数据集训练XGBoost模型，根据训练后的XGBoost模型依次对癌旁组织测试矩阵中所有相关CpG位点集合进行预测，获取预测值，根据测试特征数据集和预测值对模型进行评价，当满足评价条件时保存模型，根据模型对癌旁组织的甲基化数据进行预测。提高了预测癌旁组织中的甲基化数据的准确率，准确表达癌旁组织中的甲基化水平。
一种基于 xgboost 组织 dna 甲基化预测方法

[实用新型]一种自制冷的癌组织和癌旁组织样本双联低温采集瓶-CN202121733433.X有效
发明人：李栋;戴晓宇 -专利权人：山东省泉溪生物技术有限公司
申请日： 2021-07-28 - 公布日： 2022-01-11 - 主分类号： A01N1/02 文献下载
摘要：本实用新型公开了一种自制冷的癌组织和癌旁组织样本双联低温采集瓶，包括瓶体、双内管、夹层、标签夹、瓶塞、夹层瓶塞和内管瓶塞。本实用新型属于样本采集技术领域，具体是指一种自制冷的癌组织和癌旁组织样本双联低温采集瓶，有效的解决了目前市场上癌组织和癌旁组织样本收集时不便保证低温环境、容易混淆不来源的瘤样本和癌旁组织配对以及不便对样本进行抑菌的问题，实现了自制冷的癌组织和癌旁组织样本双联低温采集瓶方便保证低温环境、不易混淆不来源的瘤样本和癌旁组织配对以及方便对样本进行抑菌的的目的，是一种非常实用的自制冷的癌组织和癌旁组织样本双联低温采集瓶。
一种制冷组织样本低温采集

[发明专利]CD59糖蛋白的应用-CN200510029155.9有效
发明人：曾嵘;李辰;周晓;袁新雨 -专利权人：中国科学院上海生命科学研究院
申请日： 2005-08-26 - 公布日： 2007-02-28 - 主分类号： G01N33/574 文献下载
摘要：本发明通过筛选在肝细胞癌的癌组织和癌旁组织中存在差异表达的蛋白，找到了一种在肝细胞癌的癌组织中高表达的蛋白，免疫印迹实验进一步证实了CD59糖蛋白的确在肝细胞癌的癌组织与癌旁组织中存在差异表达。鉴于CD59糖蛋白与肝细胞癌的这种相关性，该蛋白可以用作检测肝细胞癌的蛋白质分子标记。
cd59 糖蛋白应用

[发明专利]细胞转录因子ILF－1的应用-CN200510029154.4有效
发明人：曾嵘;李荣霞;周晓;袁新雨 -专利权人：中国科学院上海生命科学研究院
申请日： 2005-08-26 - 公布日： 2007-02-28 - 主分类号： G01N33/574 文献下载
摘要：本发明通过筛选在肝细胞癌的癌组织和癌旁组织中存在差异表达的蛋白，找到了一种在肝细胞癌的癌组织中高表达的蛋白，免疫印迹实验进一步证实了细胞转录因子ILF－1的确在肝细胞癌的癌组织与癌旁组织中存在差异表达。鉴于细胞转录因子ILF－1与肝细胞癌的这种相关性，该蛋白可以用作检测肝细胞癌的蛋白质分子标记。
细胞转录因子 ilf 应用

[发明专利]核苷二磷酸激酶A的应用-CN200610115886.X无效
发明人：曾嵘;周晓;李荣霞;袁新雨 -专利权人：中国科学院上海生命科学研究院
申请日： 2006-08-16 - 公布日： 2007-08-01 - 主分类号： G01N33/574 文献下载
摘要：本发明通过筛选在肝细胞癌的癌组织和癌旁组织中存在差异表达的蛋白，找到了一种在肝细胞癌的癌组织中高表达的蛋白，免疫印迹实验进一步证实了核苷二磷酸激酶A的确在肝细胞癌的癌组织与癌旁组织中存在差异表达。鉴于核苷二磷酸激酶A与肝细胞癌的这种相关性，该蛋白可以用作检测肝细胞癌的蛋白质分子标记。
核苷二磷酸激酶应用

[发明专利]RhoC三磷酸鸟苷酶的应用-CN200610115882.1无效
发明人：曾嵘;周晓;李辰;袁新雨 -专利权人：中国科学院上海生命科学研究院
申请日： 2006-08-16 - 公布日： 2007-04-25 - 主分类号： G01N33/574 文献下载
摘要：本发明通过筛选在肝细胞癌的癌组织和癌旁组织中存在差异表达的蛋白，找到了一种在肝细胞癌的癌组织中高表达的蛋白，免疫印迹实验进一步证实了RhoC三磷酸鸟苷酶的确在肝细胞癌的癌组织与癌旁组织中存在差异表达。鉴于RhoC三磷酸鸟苷酶与肝细胞癌的这种相关性，该蛋白可以用作检测肝细胞癌的蛋白质分子标记。
rhoc 磷酸鸟苷酶应用

[发明专利]玻连蛋白的应用-CN200610115881.7无效
发明人：曾嵘;李辰;周晓;袁新雨 -专利权人：中国科学院上海生命科学研究院
申请日： 2006-08-16 - 公布日： 2007-07-25 - 主分类号： G01N33/574 文献下载
摘要：本发明通过筛选在肝细胞癌的癌组织和癌旁组织中存在差异表达的蛋白，找到了一种在肝细胞癌的癌组织中高表达的蛋白，免疫印迹实验进一步证实了玻连蛋白Vitronectin的确在肝细胞癌的癌组织与癌旁组织中存在差异表达鉴于玻连蛋白Vitronectin与肝细胞癌的这种相关性，该蛋白可以用作检测肝细胞癌的蛋白质分子标记。
蛋白应用

[发明专利]FK506结合蛋白4的应用-CN200510029158.2有效
发明人：曾嵘;李辰;周晓;袁新雨 -专利权人：中国科学院上海生命科学研究院
申请日： 2005-08-26 - 公布日： 2007-02-28 - 主分类号： G01N33/574 文献下载
摘要：本发明通过筛选在肝细胞癌的癌组织和癌旁组织中存在差异表达的蛋白，找到了一种在肝细胞癌的癌组织中高表达的蛋白，免疫印迹实验进一步证实了FK506结合蛋白4的确在肝细胞癌的癌组织与癌旁组织中存在差异表达。鉴于FK506结合蛋白4与肝细胞癌的这种相关性，该蛋白可以用作检测肝癌的蛋白质分子标记。
fk506 结合蛋白应用

[发明专利]己酮糖(磷酸)激酶的应用-CN200510029160.X有效
发明人：曾嵘;袁新雨;李辰;周晓 -专利权人：中国科学院上海生命科学研究院
申请日： 2005-08-26 - 公布日： 2007-02-28 - 主分类号： G01N33/574 文献下载
摘要：本发明通过筛选在肝细胞癌的癌组织和癌旁组织中存在差异表达的蛋白，找到了一种在肝细胞癌的癌组织中高表达的蛋白，免疫印迹实验进一步证实了己酮糖(磷酸)激酶的确在肝细胞癌的癌组织与癌旁组织中存在差异表达。鉴于己酮糖(磷酸)激酶与肝细胞癌的这种相关性，该蛋白可以用作检测肝癌的蛋白质分子标记。
己酮磷酸激酶应用

[发明专利]硫氧还蛋白样蛋白2的应用-CN200510029167.1有效
发明人：曾嵘;袁新雨;李辰;周晓 -专利权人：中国科学院上海生命科学研究院
申请日： 2005-08-26 - 公布日： 2007-02-28 - 主分类号： G01N33/574 文献下载
摘要：本发明通过筛选在肝细胞癌的癌组织和癌旁组织中存在差异表达的蛋白，找到了一种在肝细胞癌的癌组织中高表达的蛋白，免疫印迹实验进一步证实了硫氧还蛋白样蛋白2的确在肝细胞癌的癌组织与癌旁组织中存在差异表达。鉴于硫氧还蛋白样蛋白2与肝细胞癌的这种相关性，该蛋白可以用作检测肝癌的蛋白质分子标记。
硫氧还蛋白蛋白应用

[发明专利]G蛋白β2亚基的应用-CN200610115887.4无效
发明人：曾嵘;李辰;袁新雨;周晓 -专利权人：中国科学院上海生命科学研究院
申请日： 2006-08-16 - 公布日： 2007-08-01 - 主分类号： G01N33/574 文献下载
摘要：本发明通过筛选在肝细胞癌的癌组织和癌旁组织中存在差异表达的蛋白，找到了一种在肝细胞癌的癌组织中高表达的蛋白，免疫印迹实验进一步证实了G蛋白β2亚基的确在肝细胞癌的癌组织与癌旁组织中存在差异表达。鉴于G蛋白β2亚基与肝细胞癌的这种相关性，该蛋白可以用作检测肝癌/的蛋白质分子标记。
蛋白应用

[发明专利]细胞凋亡敏感性蛋白CAS的应用-CN200510029153.X无效
发明人：曾嵘;袁新雨;李辰;周晓 -专利权人：中国科学院上海生命科学研究院
申请日： 2005-08-26 - 公布日： 2007-02-28 - 主分类号： G01N33/574 文献下载
摘要：本发明通过筛选在肝细胞癌的癌组织和癌旁组织中存在差异表达的蛋白，找到了一种在肝细胞癌的癌组织中高表达的蛋白，免疫印迹实验进一步证实了细胞凋亡敏感性蛋白CAS的确在肝细胞癌的癌组织与癌旁组织中存在差异表达鉴于细胞凋亡敏感性蛋白CAS与肝细胞癌的这种相关性，该蛋白可以用作检测肝癌的蛋白质分子标记。
细胞敏感性蛋白 cas 应用

[发明专利]端粒酶结合蛋白p23的应用-CN200610115885.5无效
发明人：曾嵘;周晓;李辰;袁新雨 -专利权人：中国科学院上海生命科学研究院
申请日： 2006-08-16 - 公布日： 2007-04-25 - 主分类号： G01N33/574 文献下载
摘要：本发明通过筛选在肝细胞癌的癌组织和癌旁组织中存在差异表达的蛋白，找到了一种在肝细胞癌的癌组织中高表达的蛋白，免疫印迹实验进一步证实了端粒酶结合蛋白p23的确在肝细胞癌的癌组织与癌旁组织中存在差异表达。鉴于端粒酶结合蛋白p23与肝细胞癌的这种相关性，该蛋白可以用作检测肝细胞癌的蛋白质分子标记。
端粒结合蛋白 p23 应用

[发明专利]表面脂肪酸结合蛋白E－FABP的应用-CN200610115888.9无效
发明人：曾嵘;周晓;李辰;袁新雨 -专利权人：中国科学院上海生命科学研究院
申请日： 2006-08-16 - 公布日： 2007-04-25 - 主分类号： G01N33/574 文献下载
摘要：本发明通过筛选在肝细胞癌的癌组织和癌旁组织中存在差异表达的蛋白，找到了一种在肝细胞癌的癌组织中高表达的蛋白，免疫印迹实验进一步证实了表面脂肪酸结合蛋白E－FABP的确在肝细胞癌的癌组织与癌旁组织中存在差异表达鉴于表面脂肪酸结合蛋白E－FABP与肝细胞癌的这种相关性，该蛋白可以用作检测肝细胞癌的蛋白质分子标记。
表面脂肪酸结合蛋白 fabp 应用

[发明专利]星形胶质细胞磷酸化蛋白PEA－15的应用-CN200610115883.6无效
发明人：曾嵘;周晓;李辰;袁新雨 -专利权人：中国科学院上海生命科学研究院
申请日： 2006-08-16 - 公布日： 2007-04-25 - 主分类号： G01N33/574 文献下载
摘要：本发明通过筛选在肝细胞癌的癌组织和癌旁组织中存在差异表达的蛋白，找到了一种在肝细胞癌的癌组织中高表达的蛋白，免疫印迹实验进一步证实了星形胶质细胞磷酸化蛋白PEA－15的确在肝细胞癌的癌组织与癌旁组织中存在差异表达鉴于星形胶质细胞磷酸化蛋白PEA－15与肝细胞癌的这种相关性，该蛋白可以用作检测肝细胞癌的蛋白质分子标记。
星形胶质细胞磷酸化蛋白 pea 15 应用

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