本发明涉及一种快速鉴定锈斑蟳性别特异分子标记和遗传性别的方法,用于锈斑蟳性别鉴定的SNP位点,所述碱基序列为:SEQ ID NO:1或SEQ ID NO:2,长度为368bp;所述SNP位点为:SEQ鉴定方法包括:对已知性别的锈斑蟳雌雄个体DNA提取;简化基因组文库构建及高通量测序;序列分析以及性别特异SNP位点的筛选;候选SNP位点扩大样本验证;基于性别特异SNP位点的性别特异性引物的设计;利用雄性特异性引物在特定的退火温度下对锈斑蟳的基因组DNA进行PCR扩增,并根据琼脂糖凝胶电泳检测结果进行遗传性别判定。可为锈斑蟳遗传性别的鉴定提供可靠方法,特别是发育早期阶段锈斑蟳,具有操作简便、耗时短、成本低廉、重复性好,准确率高等优点。