[发明专利]一种基于二代测序结果的POLE突变判别模型的构建方法及其应用在审
申请号: | 202310245533.5 | 申请日: | 2023-03-02 |
公开(公告)号: | CN116364183A | 公开(公告)日: | 2023-06-30 |
发明(设计)人: | 陈实富;耿宇涵;杨博;曹慧雅;锁培苏 | 申请(专利权)人: | 深圳市海普洛斯生物科技有限公司 |
主分类号: | G16B20/50 | 分类号: | G16B20/50;G16B30/00 |
代理公司: | 深圳市世纪恒程知识产权代理事务所 44287 | 代理人: | 何秋石 |
地址: | 518000 广东省深圳市前海深港合作区前湾一路1号A栋201室(入驻深*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明涉及生物信息分析技术领域,尤其涉及一种基于二代测序结果的POLE突变判别模型的构建方法及其应用,所述构建方法包括S1、二代测序数据的预处理,S2、序列比对、变异判读及突变过滤,S3、突变过滤数据的分析及POLE突变判别。利用本发明的构建方法构建的POLE突变判别模型不需要明确POLE突变作为超扩增标志物,通过设置一定的突变数和最大突变丰度阈值,过滤突变位点过少导致的假阳性,并结合POLE突变判别得分标准,辅助POLE突变的确定,提高真阳性的检出率。同时,本发明的突变检测范围涵盖680个癌症相关基因,较大的检测覆盖度使得给出的得分标准更加接近预估假设,因此较为可靠。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 二代 结果 pole 突变 判别 模型 构建 方法 及其 应用 | ||
【主权项】:
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