[发明专利]一种基于高通量测序动植物基因组T2T组装方法有效
| 申请号： | 202211549592.3 | 申请日： | 2022-12-05 |
| 公开（公告）号： | CN115810395B | 公开（公告）日： | 2023-09-26 |
| 发明（设计）人： | 舒自强;蒋冕;樊鹏宇;杨路路;陈刚;苏晓俊;田朝阳;宋驰 | 申请（专利权）人： | 武汉贝纳科技有限公司 |
| 主分类号： | G16B30/10 | 分类号： | G16B30/10;G16B20/00;G16B30/20 |
| 代理公司： | 武汉天领众智专利代理事务所(普通合伙) 42300 | 代理人： | 谢非 |
| 地址： | 430000 湖北省武汉市东湖新技术*** | 国省代码： | 湖北;42 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于高通量测序动植物基因组T2T组装方法，所述方法包括：S1.基于样本测序，分别进行ONT超长测序数据组装及HiFi测序数据组装；S2.基于基因组大小评估结果对两条路线的组装结果去冗余；S3.分别对两条路线组装结果进行HiC挂载，得到染色体级别参考基因组其gap；S4.对ONT线路基因组着丝粒区域进行三代纠错，基于二代数据对ONT线路基因组进行二代纠错；S5.基于原始数据比对末端片段，根据端粒重复基序列的丰度大小进行重组装，再经比对进行末端端粒序列替换，对两条线路的端粒延伸；S6.分别对基因组序列补gap、HiFi纠错；S7.结合已知物种基因组排序对染色体进行调整得到组装后的基因组；所述T2T基因组端粒完整、无空缺，推动了动植物的研究进展。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 通量 动植物 基因组 t2t 组装 方法 | ||
【主权项】：
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