[发明专利]一种端粒到端粒的基因组组装方法有效
| 申请号： | 202211313407.0 | 申请日： | 2022-10-25 |
| 公开（公告）号： | CN115691673B | 公开（公告）日： | 2023-08-15 |
| 发明（设计）人： | 杨易;张艳;吴志坤;黎庭耀;沈卓;周轩 | 申请（专利权）人： | 广东省农业科学院蔬菜研究所 |
| 主分类号： | G16B30/20 | 分类号： | G16B30/20;C12N15/10 |
| 代理公司： | 北京方圆嘉禾知识产权代理有限公司 11385 | 代理人： | 戴嵩玮 |
| 地址： | 510640 广东*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明属于基因组组装技术领域，具体涉及一种端粒到端粒的基因组组装方法。本发明分别利用Nanopore的超长片段和PacBio高保真片段独自组装基因组，随后将Nanopore数据组装的contig作为骨架，利用PacBio片段组装的高准确性序列替换Nanopore组装共线区域低准确性序列。随后利用Hi‑C挂载contig得到染色体水平的基因组，并利用Nanopore和PacBio测序片段对基因组填补缺口和提升挂载，最终得到兼具高准确性和高连续性的端粒到端粒基因组。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 端粒 基因组 组装 方法 | ||
【主权项】：
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