[发明专利]一种基于XGBoost的癌旁组织中DNA甲基化预测方法在审
| 申请号： | 202210837114.6 | 申请日： | 2022-07-15 |
| 公开（公告）号： | CN115273977A | 公开（公告）日： | 2022-11-01 |
| 发明（设计）人： | 马宝山;刘玉;张树正;李奥;郭悦吉;王赟杰 | 申请（专利权）人： | 大连海事大学 |
| 主分类号： | G16B20/30 | 分类号： | G16B20/30;G16B40/20;G06N20/20;G06N5/00;G06K9/62 |
| 代理公司： | 大连至诚专利代理事务所(特殊普通合伙) 21242 | 代理人： | 王丹;陈义华 |
| 地址： | 116000 辽宁省*** | 国省代码： | 辽宁;21 |
| 权利要求书： | 暂无信息 | 说明书： | 暂无信息 |
| 摘要： | 本发明公开了一种基于XGBoost的癌旁组织中DNA甲基化预测方法，包括获取癌组织、癌旁组织甲基化数据集，构建癌组织、癌旁组织训练矩阵以及癌组织、癌旁组织测试矩阵；获取癌旁组织训练矩阵中所有CpG位点的相关CpG位点集合，构建训练特征数据集；获取癌旁组织测试矩阵中所有CpG位点的相关CpG位点集合，构建测试特征数据集；构建XGBoost模型，通过训练特征数据集训练XGBoost模型，根据训练后的XGBoost模型依次对癌旁组织测试矩阵中所有相关CpG位点集合进行预测，获取预测值，根据测试特征数据集和预测值对模型进行评价，当满足评价条件时保存模型，根据模型对癌旁组织的甲基化数据进行预测。提高了预测癌旁组织中的甲基化数据的准确率，准确表达癌旁组织中的甲基化水平。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 xgboost 组织 dna 甲基化 预测 方法 | ||
【主权项】：
暂无信息
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