[发明专利]一种基于深度学习的RNA和蛋白质结合位点的识别方法有效

专利信息
申请号: 202110597078.6 申请日: 2021-05-31
公开(公告)号: CN113178229B 公开(公告)日: 2022-03-08
发明(设计)人: 朱晓冬;李泽晋;刘元宁 申请(专利权)人: 吉林大学
主分类号: G16B20/30 分类号: G16B20/30;G06N3/04
代理公司: 长春市恒誉专利代理事务所(普通合伙) 22212 代理人: 鞠传龙
地址: 130012 吉*** 国省代码: 吉林;22
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摘要: 发明公开了一种基于深度学习的RNA和蛋白质结合位点的识别方法,其方法为:识别方法分为两部分:数据处理和模型设计训练,各部分主要步骤如下:第一步、数据处理:步骤1、原始数据去冗余;步骤2、预测二级结构信息;步骤3、对步骤2中获得的二级结构进行编码;步骤4、将所有数据保存在对应的csv文件中作为输入数据;第二步、模型设计及训练:步骤1、编码为数据矩阵作为模型输入;步骤2、两个特征矩阵维度相同;步骤3、将组合特征输入到编码器中;步骤4、最终编码器编码的结果;步骤5、经过sigmoid函数得到最终类别。有益效果:利用Transformer网络学习序列的长依赖性和对特征进行编码,能够有效地预测RNA和蛋白质的结合位点。
搜索关键词: 一种 基于 深度 学习 rna 蛋白质 结合 识别 方法
【主权项】:
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