[发明专利]一种基于三代PacBio和Hi-C技术组装和注释贵德黑裘皮羊基因组的方法在审
申请号: | 202110409811.7 | 申请日: | 2021-04-16 |
公开(公告)号: | CN113005189A | 公开(公告)日: | 2021-06-22 |
发明(设计)人: | 卢曾奎;刘建斌;袁超 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869;G16B20/00;C12N15/12 |
代理公司: | 北京力量专利代理事务所(特殊普通合伙) 11504 | 代理人: | 戴治娟 |
地址: | 730050 甘肃*** | 国省代码: | 甘肃;62 |
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摘要: | 本发明属于生物信息技术领域,具体涉及一种基于三代PacBio和Hi‑C技术组装和注释贵德黑裘皮羊基因组的方法,所述的方法包括如下步骤:(1)采集贵德黑裘皮羊血液和组织样本;(2)构建基因组文库和转录组文库;(3)基因组大小和杂合率评估;(4)基因组组装、利用转录测序结果纠错和评估;(5)Hi‑C辅助组装、纠错和评估;(6)基因组注释和评估。本发明组装了贵德黑裘皮羊染色体级别的高质量基因组,为进一步研究贵德黑裘皮羊的羊毛色素积淀和高寒低氧适应分子机制奠定了基础,同时也为其优良遗传资源保护和利用、分子育种和遗传改良等工作提供数据支撑。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 pacbio hi 技术 组装 注释 贵德 裘皮 基因组 方法 | ||
【主权项】:
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