[发明专利]基于二代和三代测序技术的植物线粒体基因组组装方法有效

专利信息
申请号: 202110043700.9 申请日: 2021-01-13
公开(公告)号: CN112481413B 公开(公告)日: 2022-02-15
发明(设计)人: 高海东;周向阳;徐雷 申请(专利权)人: 南京集思慧远生物科技有限公司;南京鑫普华生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/6869
代理公司: 广州科粤专利商标代理有限公司 44001 代理人: 刘明星
地址: 210000 江苏省南京市栖霞*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明公开了一种基于二代和三代测序技术的植物线粒体基因组组装方法,对样品DNA进行二代测序和三代测序,利用二代测序数据进行三代数据的校正;利用构建好的植物线粒体编码基因数据库,使用此植物线粒体编码基因数据库中所有参考序列比对第(3)步校正得到的三代序列数据集,获取seed序列进行下一步分析;对seed序列进行延伸,获取全长的线性线粒体基因组DNA序列,对线性线粒体基因组DNA序列进行环化,获取环状线粒体基因组DNA序列。本发明组装方法能够快速地从三代测序数据中得到完整的植物线粒体基因组序列,适用于大部分植物线粒体基因组。
搜索关键词: 基于 二代 三代测序 技术 植物 线粒体 基因组 组装 方法
【主权项】:
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