[发明专利]一种CRISPR目标区间变异检测的分析方法在审
| 申请号： | 202011596528.1 | 申请日： | 2020-12-29 |
| 公开（公告）号： | CN112687331A | 公开（公告）日： | 2021-04-20 |
| 发明（设计）人： | 陈全明;姜丽荣;孙子奎 | 申请（专利权）人： | 上海派森诺生物科技股份有限公司 |
| 主分类号： | G16B20/20 | 分类号： | G16B20/20;G16B20/50;G16B40/00;G16B50/30 |
| 代理公司： | 上海点威知识产权代理有限公司 31326 | 代理人： | 胡志强 |
| 地址： | 200030 上海市*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种CRISPR目标区间变异检测的分析方法，1)将高质量测序数据使用flash软件将两条reads按照overlap进行合并，再使用cd_hit软件按照短序列与长序列完全相似的标准进行聚类，获得聚类结果；2)使用mafft软件将聚类结果与目标区间进行序列的多重比对，扫描目标区间，根据扫描结果查找出突变；3)根据步骤2)中找出的突变进行分类，再结合步骤1)中的聚类结果中每一个cluster的reads数除以总聚类的reads数，得到每个cluster条目对应分类的突变率；通过本发明的分析得到的结果更接近真实情况，提高了准确率。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 crispr 目标 区间 变异 检测 分析 方法 | ||
【主权项】：
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