[发明专利]一种基于宏基因组测序的真菌定量检测方法在审
申请号: | 202011581433.2 | 申请日: | 2020-12-28 |
公开(公告)号: | CN112501347A | 公开(公告)日: | 2021-03-16 |
发明(设计)人: | 刘文兰;徐迹;黄建林 | 申请(专利权)人: | 深圳市第二人民医院(深圳市转化医学研究院) |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6806;C12Q1/06 |
代理公司: | 北京品源专利代理有限公司 11332 | 代理人: | 潘登 |
地址: | 518000 广东省深圳市福田区华富街道笋*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明提供了一种基于宏基因组测序的真菌定量检测方法,所述方法包括以下步骤:(1)向样本中依次加入皂苷和核酸内切酶,去除宿主基因组;(2)将去除了宿主基因组的样本进行破壁处理,提取核酸,获得真菌基因组;(3)将所述真菌基因组进行文库构建和高通量测序,获得原始测序数据;(4)将原始测序数据与真菌数据库进行比对,进行真菌鉴定和丰度检测。本发明在高通量测序前首先采用皂苷和核酸内切酶去除样本中的宿主DNA,显著降低了人源基因组的比例和对测序结果准确性的干扰,配合破壁处理操作,提高了真菌基因组的比例,降低了测序成本,在真菌检测领域具有重要意义。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 宏基 组测序 真菌 定量 检测 方法 | ||
【主权项】:
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