[发明专利]一种适合毕赤酵母高表达的基因序列优化方法有效
| 申请号： | 202011153706.3 | 申请日： | 2020-10-26 |
| 公开（公告）号： | CN112270956B | 公开（公告）日： | 2023-05-16 |
| 发明（设计）人： | 黄义德;林劼;林尧;江育娥 | 申请（专利权）人： | 福建师范大学 |
| 主分类号： | G16B30/00 | 分类号： | G16B30/00 |
| 代理公司： | 福州君诚知识产权代理有限公司 35211 | 代理人： | 戴雨君 |
| 地址： | 350108 福建省福州*** | 国省代码： | 福建;35 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种适合毕赤酵母高表达的基因序列优化方法，包括以下步骤：1）将要表达的蛋白质序列读入后进行处理；2）根据密码子先后组合权重，建立密码子转换矩阵；3）定义图G，其中根据要表达的蛋白质序列含有的氨基酸数量n，图G分为n层，每一层的节点都有一条边连接到下一层的节点；4）设计最大权重数组Max Weight[i，j]；5）从图G的倒数第二层开始向图G的第一层遍历，初始化当前层i层MaxWeight[i,j]为负值，并更新当前层的MaxWeight元素；6）从图G的第一层向最后一层进行遍历，通过已经计算好的MaxWeight[i，j]，输出具有最大权值的密码子组合，即优化序列。本发明通过毕赤酵母密码子对偏好性对基因序列进行优化，充分解决了最优化序列候选路径呈指数增长的问题。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 适合 酵母 表达 基因 序列 优化 方法 | ||
【主权项】：
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