[发明专利]一种基于分层深度学习miRNA-lncRNA互作关系的预测方法有效

专利信息
申请号: 202011144398.8 申请日: 2020-10-23
公开(公告)号: CN112270958B 公开(公告)日: 2023-06-20
发明(设计)人: 宋金淼;张子晨;谢凡森;段晓东;代启国 申请(专利权)人: 大连民族大学
主分类号: G16B40/00 分类号: G16B40/00;G16B30/00;G06N3/08;G06N3/044;G06N3/045
代理公司: 大连星海专利事务所有限公司 21208 代理人: 杨翠翠
地址: 116600 辽宁省大*** 国省代码: 辽宁;21
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摘要: 一种基于分层深度学习miRNA‑lncRNA互作关系的预测方法,其属于生物信息学领域。本发明的特征提取方法采用独热编码(one‑hot)和k‑mer编码,预测模型由并行胶囊网络、融合注意力机制的独立递归神经网络(IndRNN)和双向长短期记忆网络(Bi‑LSTM)组成。将序列派生的特征折叠形成维数为18×19的序列特征图像,输入到二维卷积中学习高级特征,再利用miRNA‑lncRNA相互作用序列的各种信息组合的衍生特征作为胶囊网络的输入,最终将其融合作为Bi‑LSTM的输入,进而对单一植物的miRNA与lncRNA进行互作关系预测。相比于传统生物实验室的方法,该方法数据处理量更大,更节省时间;与传统机器学习方法相比,该方法所需的特征更少,准确率更高。
搜索关键词: 一种 基于 分层 深度 学习 mirna lncrna 关系 预测 方法
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