[发明专利]一种拟合非加性效应的基因组估计育种值的方法在审

专利信息
申请号: 202010766792.9 申请日: 2020-08-03
公开(公告)号: CN111883206A 公开(公告)日: 2020-11-03
发明(设计)人: 顾林林;姜丹;方铭;王志勇 申请(专利权)人: 集美大学
主分类号: G16B20/20 分类号: G16B20/20;G16B20/30
代理公司: 重庆市嘉允启行专利代理事务所(普通合伙) 50243 代理人: 胡柯
地址: 361000 福*** 国省代码: 福建;35
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摘要: 发明公开了一种拟合非加性效应的基因组选择新方法。该方法是将基因组选择中的加性效应预测模型和非加性效应预测模型组合成一个预测模型的元算法,这种方法相较于仅拟合加性效应的预测模型通常能够获得更好的预测效果。具体步骤为:获取单个群体完整的基因型信息和表型信息;随机划分训练群体和测试群体,通过混合算法MixPGV对训练群体进行迭代训练;获得各个SNP位点的期望加性效应值和期望非加性效应值,并累加得到MixPGV预测模型的加性基因组估计育种值GEBVAdd以及非加性基因组估计育种值GEBVNon‑Add;将加性基因组估计育种值GEBVAdd和非加性基因组估计育种值GEBVNon‑Add累加得到群体的基因组估计育种值GEBV,最后计算基因组估计育种值GEBV与真实育种值的相关系数来获得估计准确度。
搜索关键词: 一种 拟合 非加性 效应 基因组 估计 育种 方法
【主权项】:
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