[发明专利]基于深度学习的MHC-I表位亲和力预测方法有效
| 申请号： | 202010539194.8 | 申请日： | 2020-06-14 |
| 公开（公告）号： | CN112002374B | 公开（公告）日： | 2022-04-22 |
| 发明（设计）人： | 任树成;宋瑾;张恒辉;沈宁 | 申请（专利权）人： | 北京臻知医学科技有限责任公司 |
| 主分类号： | G16B40/00 | 分类号： | G16B40/00;G16B20/30;G16B15/30;G06N3/08;G06N3/04 |
| 代理公司： | 北京中珒知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11806 | 代理人： | 王中;张硕 |
| 地址： | 102600 北京市大兴区中关村科技园区大*** | 国省代码： | 北京;11 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 本发明公开一种基于深度学习的MHC‑I表位亲和力预测方法，其包括：通过公共数据库获取多数个多肽；根据MHC‑I分子与肽的结合方式将所述多肽转换为21mer肽；提取所述多肽的特征，所述特征包括：序列特征、亲水性特征、极性特征和位置特征；分别对所述多肽的特征进行特征编码，得到4*21维的特征矩阵；将所述公共数据库中的多肽数据作为训练集进行模型训练，根据所述多肽的等位基因的分类，分别将所述多肽的特征矩阵输入预先建立的CNN模型建立预测模型，建立的预测模型的数量与所述多肽的等位基因的分类数据相对应；使用所述公共数据库的多肽数据作为所述预测模型的验证集进行结合亲和力测试。通过本申请能够有效预测MHC‑I表位亲和力，预测准确性较高且更稳定。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 深度 学习 mhc 亲和力 预测 方法 | ||
【主权项】：
暂无信息
下载完整专利技术内容需要扣除积分，VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于北京臻知医学科技有限责任公司，未经北京臻知医学科技有限责任公司许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/patent/202010539194.8/，转载请声明来源钻瓜专利网。
