[发明专利]一种能够高效捕获冷冻生物样本染色体三维构象的高通量测序建库技术有效
| 申请号： | 202010522547.3 | 申请日： | 2020-06-10 |
| 公开（公告）号： | CN111733214B | 公开（公告）日： | 2022-04-08 |
| 发明（设计）人： | 李付广;郑武;葛晓阳;王晔;杨召恩 | 申请（专利权）人： | 中国农业科学院棉花研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/6806 | 分类号： | C12Q1/6806;C40B50/06;C12Q1/6869 |
| 代理公司： | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人： | 张立娜 |
| 地址： | 455000 河*** | 国省代码： | 河南;41 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种能够高效捕获冷冻生物样本染色体三维构象的高通量测序建库技术。本发明提供了适用于Hi‑C高通量测序建库的样本前处理方法，包括：将供试生物样本先冷冻，再梯度升温，后交联固定。本发明FS‑Hi‑C技术不仅适用于新鲜样品，也适用于冷冻样品。本发明结果显示冷冻替换样品和新鲜样品的染色质三维结构高度相似，Hi‑C文库质量提高。与传统Hi‑C前处理方法相比，FS‑Hi‑C在染色质互作、A/B compartment和TAD等方面高度一致，且FS‑Hi‑C法构建文库质量更好，库容增加，有效互作数据更多，PCR扩增产生的重复数据降低。该技术降低了对样本时效性的要求。本发明为Hi‑C在生物中的应用提供了一种改进的方法。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 能够 高效 捕获 冷冻 生物 样本 染色体 三维 构象 通量 测序建库 技术 | ||
【主权项】：
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