[发明专利]一种CNS药物关键特征识别方法在审

专利信息
申请号: 201911307432.6 申请日: 2019-12-18
公开(公告)号: CN111081321A 公开(公告)日: 2020-04-28
发明(设计)人: 丁彦蕊;张瑞林 申请(专利权)人: 江南大学
主分类号: G16C20/50 分类号: G16C20/50;G16C20/70;G06K9/62
代理公司: 哈尔滨市阳光惠远知识产权代理有限公司 23211 代理人: 彭素琴
地址: 214000 江苏*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明公开了一种CNS药物关键特征识别方法,属于计算机辅助药物设计领域。通过将支持向量机和贪心算法相结合,利用贪心的思想逐步删除掉对提升预测结果作用最小的特征,进而准确筛选出区分CNS药物与non‑CNS药物小分子的关键特征。本发明方法首次将支持向量机与贪心算法结合起来应用于CNS药物的关键特征识别,以逐步删除的方式筛选出关键特征考虑了各个特征之间组合的效果,且避免了增加特征的方法所带来的最初特征选择的难题,使得所筛选出的关键特征更能有效区分CNS药物与non‑CNS药物小分子,这为从根本上设计CNS药物候选小分子提供了一种重要的指导方法。
搜索关键词: 一种 cns 药物 关键 特征 识别 方法
【主权项】:
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  • 罗海彬;李哲 - 中山大学
  • 2019-01-17 - 2023-09-22 - G16C20/50
  • 本发明提供一种预测药物‑靶标结合强度的绝对自由能微扰方法,包括:构建Lig体系以及Rec‑Lig体系;对Lig体系及Rec‑Lig体系的各个状态的参数进行分子动力学模拟,得到每个状态的分子动力学轨迹;通过相邻状态的力场文件进行单点能计算,得到每个相邻状态之间的势能差;对每个相邻状态之间的势能差进行概率分布统计,利用多个高斯函数的线性组合进行拟合;根据拟合后的概率分布,重新生成每一状态的势能差,通过计算得到药物与靶标的结合自由能。本发明提供的绝对自由能微扰方法,将所有自由能微扰中间状态的动力学模拟轨迹所对应的概率分布利用高斯函数进行拟合,使得采样的概率分布更加合理,大幅提升了能量计算结果的收敛性及准确性。
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