[发明专利]一种基于翻译组的环状RNA翻译多肽的检测分析方法在审
| 申请号： | 201910768511.0 | 申请日： | 2019-08-20 |
| 公开（公告）号： | CN110556162A | 公开（公告）日： | 2019-12-10 |
| 发明（设计）人： | 夏昊强;周煌凯;高川;张羽;陶勇;罗玥;陈飞钦;张秋雪 | 申请（专利权）人： | 广州基迪奥生物科技有限公司 |
| 主分类号： | G16B30/10 | 分类号： | G16B30/10;G16B50/00 |
| 代理公司： | 44202 广州三环专利商标代理有限公司 | 代理人： | 颜希文;宋静娜 |
| 地址： | 510000 广东省广州市广州国*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明提供一种基于翻译组的环状RNA翻译多肽的检测分析方法，包括如下内容：S1.将样本高通量测序获得的高质量比对序列进行TopHat比对以及鉴定，将鉴定结果过滤后，获得环状RNA序列信息；S2.对S1获得的环状RNA序列信息进行ORF注释；S3.对S1获得的环状RNA序列信息进行IRES预测；S4.结合ribosome‑seq测序数据鉴定内源性circRNA翻译产物；S5.对单样本检测到S4获得的具有junction reads的circRNA的母基因进行GO和KEGG富集分析。本发明基于翻译组的环状RNA翻译多肽的检测分析方法可以预测环状RNA的蛋白编码能力，同时结合翻译组ribosome‑seq数据，进一步找出环状RNA翻译的证据。 | ||
| 搜索关键词： | 环状RNA 翻译 序列信息 检测分析 多肽 高通量测序 测序数据 蛋白编码 翻译产物 鉴定结果 样本检测 质量比对 内源性 预测 比对 富集 过滤 样本 基因 证据 分析 | ||
【主权项】：
1.一种基于翻译组的环状RNA翻译多肽的检测分析方法，其特征在于，包括如下内容：/nS1、将样本高通量测序获得的高质量比对序列进行TopHat比对以及鉴定，将鉴定结果过滤后，获得环状RNA序列信息；/nS2、对S1获得的环状RNA序列信息进行ORF注释；/nS3、对S1获得的环状RNA序列信息进行IRES预测；/nS4、结合ribosome-seq测序数据鉴定内源性circRNA翻译产物；/nS5、对单样本检测到S4获得的具有junction reads的circRNA的母基因进行GO和KEGG富集分析。/n
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