[发明专利]一种检测CRISPR-Cas9脱靶效应的方法在审
| 申请号： | 201910583154.0 | 申请日： | 2019-07-01 |
| 公开（公告）号： | CN110343751A | 公开（公告）日： | 2019-10-18 |
| 发明（设计）人： | 邓涛;李倩;卢铀;喻堃;王越 | 申请（专利权）人： | 成都美杰赛尔生物科技有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/686 | 分类号： | C12Q1/686;C12Q1/6869 |
| 代理公司： | 成都玖和知识产权代理事务所(普通合伙) 51238 | 代理人： | 胡琳梅 |
| 地址： | 610041 四川省成都市高新*** | 国省代码： | 四川;51 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种检测CRISPR‑Cas9脱靶效应的方法，属于基因工程技术领域，其步骤包括：a.采用软件预测sgRNA的脱靶位点，并获得PCR扩增引物；b.选取基因样本，所选基因样本包括基因编辑样本和未进行基因编辑样本；c.PCR扩增预测出的脱靶位点；d.对PCR产物进行高通量测序；e.结果分析，序列比对；本发明根据指定的比对规则，将所述基因编辑后的样本与未进行基因编辑的对照样本进行比对，而不仅仅和数据库中的信息进行比对，也不需要获得子代或亲本样本基因信息，实现个性化的找寻细胞基因组上的可能脱靶位点，提高脱靶检测的准确度和灵敏度，从而提高了基因编辑的安全性。 | ||
| 搜索关键词： | 样本 基因 比对 位点 基因样本 种检测 基因工程技术 高通量测序 细胞基因组 准确度 子代 结果分析 软件预测 序列比对 样本基因 灵敏度 亲本 个性化 数据库 检测 预测 | ||
【主权项】：
1.一种检测CRISPR‑Cas9脱靶效应的方法，其特征在于，其包括以下步骤：a.预测sgRNA的脱靶位点，并获得PCR扩增引物；b.选取基因样本，所述基因样本包括基因编辑样本和未进行基因编辑样本；c.对步骤(a)预测出的脱靶位点进行PCR扩增；d.对步骤(c)所得的PCR产物进行高通量测序；e.结果分析，序列比对。
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