[发明专利]一种RNA选择性剪接位点识别方法及系统在审
申请号: | 201910305376.6 | 申请日: | 2019-04-16 |
公开(公告)号: | CN110010201A | 公开(公告)日: | 2019-07-12 |
发明(设计)人: | 孙晓勇;李瑞;魏庆功 | 申请(专利权)人: | 山东农业大学 |
主分类号: | G16B30/10 | 分类号: | G16B30/10;G16B40/00 |
代理公司: | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人: | 杨晓冰 |
地址: | 271018 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | 本发明公开了一种RNA选择性剪接位点识别方法及系统,该方法包括以下步骤:选取RNA选择性剪接位点数据和非RNA选择性剪接位点数据,并对其进行预处理,利用预处理后的数据构建训练集、验证集与测试集,并生成相应的标签;搭建卷积神经网络与循环神经网络相结合的深度学习神经网络模型;利用训练集中数据训练深度学习神经网络模型;采用训练后的深度学习神经网络模型对测试集中数据进行识别,得到RNA剪接位点和非RNA剪接位点。本发明可以快速准确的识别并预测新的RNA选择性剪接位点。 | ||
搜索关键词: | 选择性剪接 位点 学习神经网络 预处理 点数据 卷积神经网络 循环神经网络 数据构建 数据训练 测试集 训练集 验证集 标签 测试 预测 | ||
【主权项】:
1.一种RNA选择性剪接位点识别方法,其特征是,该方法包括以下步骤:选取RNA选择性剪接位点数据和非RNA选择性剪接位点数据,并对其进行预处理,利用预处理后的数据构建训练集、验证集与测试集,并生成相应的标签;搭建卷积神经网络与循环神经网络相结合的深度学习神经网络模型;利用训练集中数据训练深度学习神经网络模型;采用训练后的深度学习神经网络模型对测试集中数据进行识别,得到RNA剪接位点和非RNA剪接位点。
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