[发明专利]一种在转录组测序水平上进行剑麻叶纤维发育的研究方法在审
| 申请号： | 201910288830.1 | 申请日： | 2019-04-11 |
| 公开（公告）号： | CN110029185A | 公开（公告）日： | 2019-07-19 |
| 发明（设计）人： | 程琴;金刚;彭欣怡;谭秦亮;吕平;朱鹏锦;周全光;陈涛;卢业飞;王丽萍;欧克纬;李佳慧 | 申请（专利权）人： | 广西壮族自治区亚热带作物研究所（广西亚热带农产品加工研究所） |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895 |
| 代理公司： | 重庆项乾光宇专利代理事务所(普通合伙) 50244 | 代理人： | 高姜 |
| 地址： | 530001 广*** | 国省代码： | 广西;45 |
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| 摘要： | 本发明公开了在转录组测序水平上进行剑麻叶纤维发育的研究方法，包括以下步骤：s1.培育剑麻参试材料，并进行剑麻叶RNA的提取及质量检测；s2.进行剑麻叶纤维的转录组测序；s3.进行转录水平差异比较分析，筛选出差异表达基因；s4.进行差异表达基因的GO功能显著性富集分析和Pathway显著性富集分析；s5.从转录组数据中挑取两种不同表达趋势的4个基因在不同纤维发育时期进行实时荧光定量PCR试验，并与RNA‑Seq转录组数据中该基因的表达趋势进行吻合性检测，验证RNA‑Seq转录组数据的可靠性；本发明为深入开展纤维发育相关功能基因的克隆和功能验证提供理论基础，为剑麻纤维品质的遗传改良提供理论依据。 | ||
| 搜索关键词： | 转录组 剑麻叶 纤维 测序 差异表达基因 显著性 发育 富集 实时荧光定量PCR 相关功能基因 参试材料 差异比较 发育时期 功能验证 剑麻纤维 理论基础 遗传改良 质量检测 转录水平 吻合性 分析 基因 剑麻 克隆 验证 筛选 研究 检测 试验 培育 | ||
【主权项】：
1.在转录组测序水平上进行剑麻叶纤维发育的研究方法，其特征在于，包括以下步骤：s1.培育剑麻参试材料，并进行剑麻叶RNA的提取及质量检测；s2.进行剑麻叶纤维的转录组测序；s3.进行转录水平差异比较分析，筛选出差异表达基因；s4.进行差异表达基因的GO功能显著性富集分析和Pathway显著性富集分析；s5.从转录组数据中挑取两种不同表达趋势的4个基因在不同纤维发育时期进行实时荧光定量PCR试验，并与RNA‑Seq转录组数据中该基因的表达趋势进行吻合性检测，验证RNA‑Seq转录组数据的可靠性。
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